Neo：123 則幕後冷知識
Gloria Foster在拍攝她的戲份前因糖尿病過世，華卓斯基姊妹只好重新選角，找來Mary Alice飾演先知。她們決定在駭客任務的世界觀中，設定住在矩陣裡的程式可以改變，並自行選擇形體與外貌。就先知而言，進入矩陣（2003）解釋道，梅若賓基恩取走她當下的殘餘自我形象，以懲罰她幫助尼歐，逼她退回能力有限、較年長的化身。
根據DVD特別收錄，尼歐螢幕上出現的台詞包括「You can't control me!」、「I can say whatever I want!」、「FUCKING DICK!」、「I'll smash you to fucking bits!」、「I'll fucking kill you!」、「You old, white, prick!」、「You can't make me do that!」、「FUCK YOU!」等等，因此全片共有5個f字髒話，包括那句法語的。
史密斯探員開槍殺死尼歐時，其實是藉由一句「Good bye, Mr. Anderson!」正式宣告尼歐以救世主之姿誕生。那一刻，矩陣殘留在尼歐身上的最後一絲痕跡被移除，他的心智獲得自由，成為救世主。
在電腦中，「cookie」是一種資料。先知給尼歐的餅乾，既是字面上的餅乾，也是比喻。
尼歐與莫菲斯懸掛在直升機下的鏡頭由替身演出，只有較近的鏡頭能看到費許朋和李維的臉時例外。剪輯師Zach Staenberg表示，為了拍成所有飛行鏡頭，他們必須「實實在在地改寫雪梨的法則」。
Mark Wahlberg曾被認真考慮，也極力爭取尼歐一角。
根據服裝設計Gloria Bava的說法，尼歐原本的大衣是銀色皮革。後來改掉，因為厚重材質連風扇吹拂下都幾乎不動，而導演們想要能飄揚翻飛、宛如劇本中所寫「液態天空」的效果。他們找到一種較輕的黑色布料，每碼只要3美元。
尼歐與史密斯對打的高樓房間，是電影製作辦公室的複製品。
令人毛骨悚然的巧合是，尼歐的護照在2001年9月11日到期。
首支前導預告透過WhatIsTheMatrix.com曝光，當中包含尼歐藥瓶的鏡頭，藥是開給他在矩陣中的另一個身分Thomas Anderson。藥名為「Ontolofloxin」，巧妙改自本系列對本體論（即存在本質）的探討。
片頭與3名探員對打時，尼歐把其中一名探員踢向Darrow Industries製造的路燈，這是向矩陣系列概念設計師Geofrey Darrow致敬。
尼歐在公寓碰面購買非法軟體的人叫Choi，他的女友叫DuJour。在法語中，這對情侶合起來是「Choi Dujour」，意即「今日之選」，又是對片中選擇之重要性的一處玩笑式呼應。Dujour身上有白兔刺青，是眾多《愛麗絲夢遊仙境》典故之一。Choi稱尼歐為「My own personal Jesus Christ」，預示尼歐身為救世主、宗教人物的地位。Dujour也可能是一語雙關：「Femme du Jour」（今日之女），暗示Choi的女友是妓女。
李奧納多·狄卡皮歐辭演尼歐，據說是因為擔心視覺特效的數量。
這是三部曲中唯一尼歐使用槍械的一集，也是唯一在20世紀及第2個千禧年上映的一集。
截至2016年4月，DARPA的研究團隊正在進行一項聚焦於標靶神經可塑性訓練（縮寫TNT）的計畫，做法是在頸部底部放置電極，以電脈衝影響人的神經傳導物質，目的是讓探員能在極短時間內學會語言和其他複雜科目。這類似尼歐被接上訓練程式以更快學會複雜技能，只是沒那麼具醫療侵入性。
先知與尼歐在市区公園初次會面時，她請他吃紅色甘草糖。尼歐猶豫一番後收下，接著先知也為自己拆開1顆紅色糖果。仔細看的話，有短短幾格畫面會發現她放進嘴裡的其實是1顆紅色膠囊。
本片大量向Lewis Carroll的《愛麗絲夢遊仙境》致敬，同時也提及Karl Marx、Franz Kafka、禪宗和荷馬的《奧德賽》。片中重點出現的文學作品之一，是法國哲學家Jean Baudrillard的《Simulacra and Simulation》。這本書攤開放在尼歐的公寓裡，而且是所有主要演員與工作人員的必讀之作。
莫菲斯向尼歐解釋什麼是矩陣時，說了「Welcome to the desert of the real.」這句話改寫自Jean Baudrillard的Simulacra and Simulation，也就是尼歐藏非法軟體的那本挖空書。引文見於第一章The Precession of Simulacra，第1頁第2段：「真正留存下來的，是那真實本身，而非地圖；它的殘跡零星散落在沙漠各處，那些沙漠已不再是帝國的，而是我們的。那真實的沙漠本身。」註：Baudrillard此書的美國版書名為Simulations，1983年由Semiotext(e)出版。
威爾·史密斯曾受邀飾演尼歐，但為了主演飆風戰警（1999）而婉拒。他後來坦承，當時自己「作為演員還不夠成熟」，若接下這個角色「一定會搞砸」。他並不後悔，還說「基努飾演尼歐非常出色」。他也提到，若由他演尼歐，片廠屬意由Val Kilmer演莫菲斯，如此一來觀眾就無緣見到勞倫斯·費許朋的經典演出。珊卓·布拉克曾受邀飾演崔妮蒂，但因威爾·史密斯演出本片而拒絕。她對此決定感到後悔；若她接演，就能與先前合作捍衛戰警（1994）的基努·李維再度同台。
飾演先知（Oracle）的葛洛莉亞·福斯特（Gloria Foster）因糖尿病過世，來不及拍完第3集和遊戲《進入矩陣》（2003）的任何戲份。先知一角在第3集與遊戲中改由瑪麗·愛麗絲（Mary Alice）接演。華卓斯基姊妹決定在《駭客任務》的世界觀裡，程式可以改變，也能自行選擇形態與外貌。在《進入矩陣》中，先知外貌的變化有明確交代：她親口向尼奧比和鬼魂說明，梅若賓基恩因為她指點尼奧去找他而懲罰她，害他失去了造鑰匙人和幾名忠心手下，於是報復性地偷走她舊的殘留自我形象，逼她改用更舊的形象，連帶使她的部分能力受限，例如記憶。到了《最後戰役》，莫菲斯和崔妮蒂初次見到「新」先知時的對話也做了調整，以呼應她外貌的改變。另一個做法是讓莫菲斯和崔妮蒂裝作沒察覺，但那樣恐怕更尷尬。很有意思的是，西班牙首映時，福斯特的配音員胡安娜·貝特（Juana Beuter）繼續為愛麗絲配音，讓先知（至少在西班牙）擁有兩個不同的身體，聲音卻是同一個。
為了拍攝尼奧和史密斯在空中向上飛向天空的戰鬥效果，劇組特別建造了一個被稱為「音叉」的飛行裝置，該裝置可360度旋轉。
基督教象徵：電影開頭，崔爾對尼奧說：「哈利路亞。你是我的救世主，老兄。我個人的耶穌基督。」的確，尼奧與基督有幾處相似之處。他是否是「救世主」的問題反映了基督是否真是彌賽亞的問題（兩者都是預言中將降臨的救世主）。此外，他的姓氏安德森在詞源上意為「人子」，這是聖經中指代基督的短語。像基督一樣，他被宣告死亡但隨後復活。名字「崔妮蒂」（如聖三一）也增添了基督教主題。
湯瑪斯·安德森，又名尼奧，在整部電影中總共醒來7次。
湯姆·克魯斯最初是尼奧角色的考慮人選。
根據作曲家唐·戴維斯（Don Davis）的說法，強尼·戴普是華卓斯基姊妹對尼奧的首選，但華納兄弟希望由布萊德·彼特或方·基墨出演。在他們拒絕後，華納願意考慮戴普，最終人選縮小到戴普和基努·李維，而華納力推後者。
在功夫訓練期間，尼奧用拇指摩擦鼻子一側。這是對李小龍的致敬，他以這個習慣動作聞名。
尼奧第一次與朋友聊天（那些帶他去夜店並遇見崔妮蒂的朋友）的場景充滿了預示。他的一個朋友稱尼奧為「我的救世主，我個人的耶穌基督」，然後在聽到關於他電腦的奇怪故事後，打趣說「你需要斷開連接，老兄」。
長期以來，粉絲們一直猜測給尼奧送手機的FedEx快遞員是老鼠，但FedEx快遞員是由另一位演員大衛·奧康納（David O'Connor）飾演的。
當尼奧在房間裡與史密斯探員會面時，他實際上並不知道對方是史密斯探員，但當時背景中有一個史密斯探員的半身像正被拳打臉部。
在電影海報上，賽佛、尼奧和莫菲斯被描繪成右手持武器，而凱莉-安·摩絲是左撇子。在現實生活中，祖·彭杜利安奴、基努·李維和勞倫斯·費許朋都是左撇子，而凱莉-安·摩絲是右撇子。
尼奧與史密斯戰鬥中的燈光效果類似於從史密斯身上長出的魔鬼翅膀。由於電影的一個理念是尼奧是耶穌基督，這呈現出這是基督與魔鬼為了世界而戰的想法。
當尼奧與史密斯克隆人戰鬥時（即「群毆大戰」），使用了一些非傳統的音效。當尼奧被踢飛並撞倒一群史密斯時，使用了多米諾骨牌倒下的聲音。在戰鬥結束時，當尼奧抓住史密斯的腿將其扔向他的克隆人時，使用了保齡球擊倒球瓶的聲音。
在結尾場景中，尼奧蒙著眼睛向前伸出手，徒手阻止了哨兵。這與基努·李維在《甜蜜的十一月》（2001）結尾所做的動作完全相同。
作為選角過程的一部分，電影的編劇兼導演搭檔華卓斯基姊妹安排了一次試鏡，以檢驗設想的尼奧和崔妮蒂人選之間是否有化學反應。這是凱莉-安·摩絲和基努·李維第一次見面。摩絲走進房間說：「嗨，我是凱莉-安。」李維說：「嗨，我是基努。」
分析師的貓名叫「似曾相識」，這明顯是向《駭客任務》（1999）中尼奧在走廊裡看到一隻貓重複動作的場景致敬。目睹這一事件後，尼奧驚呼「似曾相識」。
潔達·蘋姬·史密斯曾試鏡崔妮蒂一角。她後來在《駭客任務：重裝上陣》（2003）中飾演尼奧比。她的丈夫威爾·史密斯曾被邀請出演尼奧，但他拒絕了。
尼奧對戰史密斯及其克隆人的戰鬥序列（也稱為「群毆大戰」）拍攝了27天。
軟體公司Deus Machina是機器城市中複合實體的名字，該實體安排了尼奧在《駭客任務完結篇：最後戰役》（2003）結尾與史密斯戰鬥。
當尼奧和史密斯第一次見面時，他們身後的柵欄上有一些白色塗鴉。塗鴉是用盧恩字母寫成的，拼出「thew」（thorn, eoh, wynn）。「Thew」是古英語，意思是僕人或奴隸。這與電影的主題相關。
尼奧在城市街道上凝視天空的鏡頭中，可以看到一個寫著「Corky's Massage Spa & Salon」的招牌，上面有一個雙斧圖標。Corky是華卓斯基姊妹早期電影《驚世狂花》（1996）中的主角，由吉娜·葛森飾演，她的手臂上有一個雙斧紋身。
史密斯一拳打在尼奧胸口，將他向後擊飛後，尼奧吐出血來，然後站起來。站起來後，他以戰鬥姿勢挑釁史密斯。這個姿勢源自合氣道風格。
在群毆大戰序列中，尼奧最終與超過80個史密斯探員戰鬥。
Neo與Smith最終決戰中許多「雨滴」，其實是單行的Matrix程式碼，跟三部曲中「真實世界」螢幕上看到的一樣。這個細膩效果是為了暗示Matrix已開始不穩定。在IMAX及較大的戲院裡很容易察覺，但在較小的電視上則會呈現為條帶狀的雨，在打鬥特寫時像雜訊般「跳動」。
Trinity聯絡Neo時，Neo正在聽的那首歌是Massive Attack的「Dissolved Girl」。說來奇怪，這首歌並未收錄在電影原聲帶中，儘管它是片中第一首歌，且出現在重要場景裡。
Neo吃麵、Trinity從他身旁走過的那家麵店，其實是位於舊金山Kearny街的The House of Nanking。正對面有一家店的招牌寫著「Zoetrope」。zoetrope是1830年代發明的裝置，能藉由一連串圖片製造出影像移動的錯覺，從拉丁文直譯成英文就是「Wheel of Life」。兩者都是本片的核心主題。所指的店其實是Cafe Zoetrope，是Francis Ford Coppola名下歷史建築Sentinel Building裡的餐廳。同樣地，他的製作公司就叫「American Zoetrope」。這也是向第一集《駭客任務》致敬——Neo曾向Trinity提到，他以前因為那裡的麵而常去那家餐廳。那是他「醒來」後第一次回到Matrix；當時他們正開車去見Oracle。
Neo第一次嘗試跳躍時摔落的那場戲，是仿照Wile E. Coyote設計的。
John Cusack曾極力爭取Neo一角。
1990年代初《駭客任務》還在早期開發階段時，Lana與Lilly Wachowski為Neo一角的首選是Brandon Lee，但他不幸在《龍族戰神》(1994)片場身亡。
David Duchovny為了演出《The X Files》(1998)，婉拒了Neo一角。
Neo到Oracle的公寓見她時，背景正播放著爵士標準曲「I'm Beginning to See the Light」；《駭客任務》(1999)對應場景中播放的也是同一首歌的另一個版本。
Neo在訓練程式中與Morpheus對打時，配樂依序播放的3段音樂被作曲家Don Davis稱為「Bow Whisk Orchestra」。它由Davis以亞洲樂器演奏的半即興樂段、Lunatic Calm的歌曲「Leave You Far Behind」，以及Davis另一首名為「Switch or Break Show」的曲子組成。「Bow Whisk Orchestra」與「Switch Or Break Show」都是「Wachowski Brothers」的字母重組。此外，Neo、Morpheus與Trinity見過Oracle後回到大樓時，播放的樂曲叫「Threat Mix」。後來在同一棟大樓裡Morpheus與Agent Smith對打時，樂曲叫「Exit Mr. Hat」。「Threat Mix」與「Exit Mr. Hat」都是「駭客任務」的字母重組。
在Neo與Agent Smith最終決戰期間以及片尾字幕時，以西方風格誦念了以下梵文偈語：「Asatoma Sat Gamaya, Tamasoma Jyotir Gamaya, Mrityorma Anritam Gamaya」，意思是「引我從虛幻走向真實，引我從黑暗走向光明，引我從短暫走向永恆」。
Neo是One的字母重組。
Jessica Henwick飾演的角色Bugs，名字取自Bugs Bunny，既是向華納兄弟另一位人氣角色致意，也呼應第一集《駭客任務》中Neo必須追隨的「White Rabbit」。
Neo（基努·李維）出任務拯救Morpheus（勞倫斯·費許朋）時，至少帶了2對Beretta 92FS手槍。帶著好幾把同款手槍看似荒謬，但與其重新裝彈，不如打完就丟、再抽出「全新」的槍，尤其像Neo在片中那樣雙槍並用時更是如此。這種做法在燧發槍時代也早有先例，據說強盜或海盜上戰場時會帶多達6把已裝彈的單發手槍。
Neo被植入蟲子的偵訊場景，結合了實體與數位特效。探員們壓住Neo、讓Agent Smith啟動鑽進他肚臍的蟲子那場戲，用了義肢腹部；注意他肚臍幾吋外有個小凹痕，是塑膠稍微彎折所致。片中還用遙控裝置模擬蟲子進入他胃裡後扭動的觸鬚。蟲子本身也是CGI與機械動偶的結合：啟動那場是CGI，在肚子上扭動的鏡頭是實體拍攝，鑽進肚臍時則是CGI。
Neo與Smith在彈坑中對打的街角，正是《駭客任務》(1999)結尾Neo打電話的同一街角——澳洲雪梨Pitt、Hunter與O'Connell三條街的交會處。他們落地時，可以看到右邊的電話亭。
「Burly Brawl」場景（Neo大戰數十個Agent Smith）的真人拍攝以18秒為單位分段進行，以便變換攝影角度，捕捉Neo必須完成的250多個動作。部分打鬥段落過於複雜，因此完全以數位方式製作，用電腦生成的Neo與Smith複製人；視覺特效團隊以Sony HDR-900高畫質攝影機掃描了基努·李維與曉高·韋榮的影像。其中一些鏡頭曾因看起來太假而受到批評；不過影迷倒是替它想出了一套片中的解釋：既然Neo與Smith複製人都是極強大的程式，動作又極其複雜，它們的程式碼可能佔用太多虛擬資料空間，連Matrix程式本身都無法逼真地算繪（就像電玩遊戲的圖形輸出超出主機處理器負荷時會變慢一樣）。這個理論不算太牽強，因為《駭客任務》(1999)已證實，程式在運行中被修改時，Matrix也會明顯出現程式錯誤。
伊旺·麥奎格之所以婉拒尼歐一角，是因為當時正在拍攝《星際大戰首部曲：威脅潛伏》（1999）。隔年奧斯卡頒獎典禮上，兩部片將在最佳視覺效果獎項正面交鋒，最後由《駭客任務》抱回獎座。
尼可拉斯·凱吉因家庭因素導致檔期衝突，推掉了尼歐這個角色。
為了替系列作品中的角色做準備，基努·李維被要求閱讀3本書：《Simulation and Simulacra》、《Out of Control》與《Evolution Psychology》。而進入母體前的尼歐用來藏匿駭客程式的挖空書本，正是《Simulation and Simulacra》。
尼歐與史密斯首次面對面交鋒時，史密斯眼鏡上清楚可見一塊燈光板的倒影。難得的是，這竟是全片唯一一次出現這種情況，畢竟三部曲中戴墨鏡的角色何其多。
尼歐吞下紅藥丸前的名字是湯瑪斯·安德森。湯瑪斯取自聖經中的使徒多馬，也就是為人熟知的「多疑的多馬」。尼歐在服下紅藥丸前，以及後來接受自己救世主身分的過程中，都展現出類似的特質。
片頭尼歐在母體中沉睡時，其中一筆非法電腦搜尋紀錄顯示，莫菲斯曾在希斯洛機場擺脫警方追緝。
威爾·史密斯接獲尼歐一角的邀約時，華卓斯基姊妹曾考慮讓他與方·基墨搭檔，由後者飾演莫菲斯。史密斯表示，華卓斯基姊妹向他推銷的內容只有那幕凌空飛踢。這讓他心生疑慮，於是選擇接演《飆風戰警》（1999），該片在口碑與票房上雙雙慘敗，還讓他抱回2座金酸莓獎。該片同時拿下最爛影片獎。
片尾尼歐單手對戰史密斯探員時，用來防身的招式正是《小子難纏》（1984）中宮城先生傳授給丹尼爾的那幾招：給車子上蠟、粉刷圍籬、打磨地板和油漆房子。
尼歐收到的FedEx信封上，FedEx標誌以紅、藍兩色字體呈現。他簽收時所用的筆，則可選擇紅色或藍色墨水。這些物件預示並呼應了尼歐接下來在紅藥丸與藍藥丸之間的抉擇。那支筆極可能是提供紅、藍、綠、黑4色墨水的Bic 4色原子筆。
用來從尼歐脊椎移除植入連接器的撐開器具，其實是一支鼻窺器，也就是在鼻腔檢查或手術時用來撐開鼻孔的器械。
莫菲斯在建構空間裡展示給尼歐看的那台古董電視，是AWA（Amalgamated Wireless - Australasia）Radiola「Deep Image」209C型或極為相似的機型，約製於1958年。它底部附有布質網罩的喇叭部分已不翼而飛，很可能是美術設計為了讓外觀更簡潔而拆掉的。
尼歐與造物主對談期間，若開啟字幕，可以看到螢幕上尼歐的分身們紛紛爆出這些話：「你控制不了我！」「我要把你砸個稀巴爛！」「我一定要他媽的殺了你！」「你這個老白鬼，休想逼我做任何事！」
根據拉娜·華卓斯基的說法，她決定讓尼歐與崔妮蒂在續集中回歸，靈感來自雙親（兩人過世時間僅相隔5週）與一位摯友的離世。寫作的過程，是她面對死亡時安慰自己的方式。她還將尼歐與崔妮蒂定義為自己生命中最重要的2個角色。然而對莉莉·華卓斯基而言，這份失落感正是她決定不再回歸該系列的部分原因。她原話說道：「我不想在經歷了變性、經歷了人生這場巨大動盪，以及失去母親和父親的傷痛之後，還想回頭去做以前做過的事。」
尼歐與莫菲斯以同一招式互相攻擊，再加上兩人的衣著與頭部、髮型，共同構成了太極陰陽符號。
片中提及的2條高速公路分別是101號與303號。這兩個數字也恰好是《駭客任務》（1999）中尼歐公寓與「城市之心」飯店房間的門牌號碼。
尼歐與造物主對峙時，造物主對他說：「（完美母體的）毀滅如今在我看來顯而易見，這是每個人類與生俱來的不完美所導致的後果。」在這2句台詞播放期間，監視螢幕上閃過的畫面包括以色列總理艾里爾·夏隆、阿道夫·希特勒、核彈爆炸、海珊、小布希以及美國國防部長唐納德·倫斯斐。
含劇透的冷知識
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尼歐曾3度動念想回到原來的生活，而非繼續向前：第1次是崔妮蒂在他正要下車時對他說：「因為你已經去過那裡了，尼歐。你認得那條路，你清楚它通往哪裡。而我知道，那並不是你想去的地方」；幾分鐘後莫菲斯第2次給他選擇，讓他可以吞下藍藥丸回到原本的生活，愛信什麼就信什麼；第3次則是祭師告訴他，他不是救世主，但或許下輩子會是。
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尼歐初次登場時，正趴在電腦前睡著。螢幕上快速變換的畫面中，有一張是某份真實阿拉伯文報紙的頭版。報名粗略翻譯過來意思是「正午」。此外，版面主體報導的是1990年代末期黎巴嫩基督徒與敘利亞總統阿薩德之間的談判。
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片頭尼歐被告知要「跟著白兔走」，而Dujour身上正刺著一隻白兔。華卓斯基姊妹如此安排，是向路易斯·卡羅的《Alice in Wonderland》致敬：愛麗絲跟著一隻白兔掉進兔子洞，就此踏入奇幻的仙境世界。尼歐與莫菲斯會面的那場戲中，莫菲斯也在對白裡提到這件事；他讓尼歐在藍藥丸與紅藥丸之間二選一，尼歐選了紅藥丸，藉此脫離母體。
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尼歐在地鐵站獨自被探員堵上，雙方彈匣雙雙打空時，探員說道：「你沒子彈了。」這句話預示了尼歐終於讓自己的心靈獲得解放。
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建築師橋段中，監視器上出現的多個尼歐並非如一般人可能以為的，是他那些前任者（救世主的前世）造訪源頭時被拍下的反應。根據拍攝腳本，他們代表尼歐各種可能的回答選擇，鏡頭則拉近到實際發生的結果。這呼應了建築師所說自由選擇對人類不可或缺，這個主題在《駭客任務》與《駭客任務完結篇：最後戰役》(2003) 中反覆迴盪，也是機器難以理解的概念，因為牠們依因果律而活。
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電影前 45 分鐘裡，尼歐共有 80 句台詞，其中 44 句是問句，平均大約每分鐘問一個問題。
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審訊場景中尼歐嘴巴融化的畫面，是刻意向 Harlan Ellison 的科幻小說《I Have No Mouth, and I Must Scream》致敬，這部作品也是本片的眾多靈感來源之一。這場戲結合了電腦特效與實體特效：他的雙唇化為黏稠血肉黏合又分開、最後封死的效果是電腦特效，其餘鏡頭則以實體方式拍攝。工作人員在基努·李維的嘴上覆蓋石膏與特效化妝，來模擬後者的效果。
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電影開頭尼歐在 Metacortex 與老闆會面時，老闆談到了選擇。這位老闆名叫 Rhineheart，可能是在影射《The Dice Man》的作者 Luke Rhinehart——一本關於選擇的書。
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開拍第 1 天拍攝的是尼歐在辦公室接到莫菲斯的電話、並試圖逃離探員的場景。
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尼歐第 1 次和崔妮蒂一起上車時，Switch 稱他為「Coppertop」。Coppertop 是她對金頂（Duracell）電池的暱稱，也正是莫菲斯向尼歐解釋人類如何變成能源時展示的那種電池。
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在 00:15:11 處，尼歐映在桌面上的倒影是另一個人。幾場戲之後，他在浴室鏡中的倒影也短暫閃現成另一個人。這些都是事情並非表面那樣的早期線索。後來劇情解釋，尼歐在別人眼中會呈現成另一個人的模樣，這也是花了那麼久才找到他的原因之一。
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地鐵打鬥後，尼歐被告知前往的飯店與房號，和電影開頭崔妮蒂等待警察的飯店與房號相同。
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湯瑪斯·安德森任職的公司名叫 Metacortex。這個字的字根是 meta-，根據韋氏辭典意指「超越、凌駕、超脫」，以及 -cortex，意指「包圍大腦的灰質外層（界線）」。因此 Metacortex 的意思是「超越大腦的界線」，而這正是尼歐接下來所做的事。
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尼歐與史密斯會面、洽談製作新的《駭客任務》電玩時，背景裡可以看到一尊半身像，刻畫的是史密斯探員在《駭客任務完結篇：最後戰役》(2003) 的 Super Burly Brawl 中挨的那記慢動作重拳。
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尼歐在連接《駭客任務》的培養槽中醒來的那場戲，培養槽刻意做得骯髒、陳舊又陰森。測試槽內呼吸裝置時，測試員在不到 8 分鐘內就失溫，因此培養槽必須加熱。
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為了準備尼歐在培養槽中醒來的戲，基努·李維減重 15 磅，並剃光全身毛髮，讓尼歐看起來消瘦憔悴。
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尼歐打給 Guns and Ammo 的電話號碼是 555-0161。
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崔妮蒂的分身 Tiffany 如今嫁給了「Chad」，由 Chad Stahelski 飾演，他曾與基努·李維合作執導《John Wick》系列。事實上，他在最初的《駭客任務》三部曲中就是基努·李維的替身——因此兩人都演過尼歐。某種程度上，崔妮蒂嫁給了尼歐。
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由於基努·李維頸部受傷，部分動作場面必須重新安排，以配合他完全康復。因此，拍攝先從不太需要體力負荷的場景開始，例如湯瑪斯·安德森老闆辦公室的戲、審訊室的戲，以及載尼歐去見先知的那場車戲。
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史密斯探員在三部曲中只叫過尼歐「尼歐」1 次，就是在 burly brawl 的結尾，也就是三部曲最後的史詩決戰。這可能有幾個原因。其一，他是在重複先知對尼歐說過的話，因為史密斯如今就是先知，擁有「先知的眼」。另一個原因是史密斯如今尊重尼歐，以尼歐偏好的稱呼來叫他。
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尼歐與史密斯探員在地鐵的高潮對決戲，進度比預定超期 10 天。
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尼歐身上大部分的針灸針都插在覆蓋基努·李維胸部的義肢上。不過，他耳朵上的針是真的，由片場真正的針灸師扎入。
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尼歐見到莫菲斯時，對方給他 2 顆藥丸，一紅一藍，藍色象徵留在《駭客任務》裡，紅色象徵離開《駭客任務》、回到真實世界。這預示了他自己的抉擇：尼歐吞下紅藥丸醒來後，身處一個裝著紅色液體的巨型培養槽中。這意味著一顆巨大的「紅藥丸」，裡頭不只裝著他，還裝著被封裝在無數紅藥丸中的其他人類。
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尼歐與建築師的對話揭示，尼歐身處《駭客任務》的第 6 次循環，是異常現象的第 6 個版本。因此，也可以稱他為「6 號」。華卓斯基姊妹是電視劇《密諜》(1967) 的知名粉絲（第 1 集片中曾出現一閃而過的該劇片段）。該劇主角同樣重視個體性、對抗體制，正是 6 號。這齣電視劇的粉絲會發現這兩個數字之間更深的關聯，但那就會劇透另一部作品的結局了。
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尼歐使用的「氣功波」，最初是為《駭客任務：重裝上陣》構思的「救世主」能力之一，而且一直保留在該片劇本中，直到前製後期才被刪去。
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尼歐與崔妮蒂最後所在的那棟大樓（市中心辦公摩天大樓），令人聯想到《駭客任務》遊戲的起始關卡（該關卡本身取材自芝加哥著名的中央郵局）。
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Bugs（其中一個角色）表示自己的名字取自兔寶寶。電影後段，當他們把尼歐從駭客任務中救出時，Bugs 說出了口頭禪「What's up Doc?」。
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在一句被刪掉的台詞裡，賽佛向尼歐解釋，莫菲斯過去曾找出好幾位可能的救世主候選人，他們全都在試圖對抗探員後喪命。
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崔妮蒂在車上替尼歐取出蟲子的那台取蟲器，其實是真正能運作的裝置，模型師花了 12 週才打造完成。
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在《駭客任務》(1999) 中，莫菲斯向尼歐講述救世主的故事時提到，祭師預言救世主將會歸來，而他的到來將導致駭客任務毀滅，並終結人類與機器之間的戰爭。到了電影結尾，戰爭確實結束了，但當被同化的尼歐徹底消滅史密斯探員時，駭客任務並未遭到摧毀；駭客任務被重置，真相向人類大眾揭露，而他們獲得了被解放的機會。在《駭客任務》(1999) 中，莫菲斯早已提過，祭師會告訴你「你[當時]需要聽到的話」，而且「知道路和走上路是兩回事」。在更早的一場戲裡，他解釋「這些人[在駭客任務裡]大多還沒準備好被拔掉插頭」。莫菲斯在第 1 集中的說法，就這樣為《駭客任務完結篇：最後戰役》的結局埋下伏筆。
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凱莉-安·摩絲試鏡時，用的是夜店裡她第一次接近湯瑪斯·安德森（也就是尼歐）的那場戲。
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在格鬥訓練程式裡，尼歐與莫菲斯對打前，用拇指抹了抹鼻子，動作類似李小龍攻擊對手前的習慣。這個動作是基努·李維即興加上的。
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尼歐被設定為一位知名、屢屢獲獎的製作人。片中有一幕是他因製作駭客任務電玩而獲頒獎座。這座獎座與每年 The Game Awards 頒獎典禮上頒發的獎座一模一樣。
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祭師與尼歐對談的內容幾乎句句成真，尤其是其中 3 句台詞：「也許是你的下一世吧」、「你們其中一個[尼歐或莫菲斯]會死」，以及「拿塊餅乾吧。我保證等你吃完，就會覺得一切順心如意」。前兩句直接呼應尼歐最後在飯店與探員激戰時真正成為救世主；第 3 句則暗示建築師在《駭客任務：重裝上陣》中提到的「主要程式」被植入或啟動，因為尼歐吃完餅乾後，力量便開始甦醒。
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在開場戲中，Bugs 沿著一塊亮著燈的招牌滑下，從屋頂逃脫。招牌上的直排字母拼出「ANDERSONS」，顯示它與 The Modal 的設計者、尼歐尚未覺醒的另一身分湯瑪斯·安德森有關。「ANDERSONS」招牌下方還有另一塊招牌，寫著「FOR THOSE WHO LOVE TO EAT SHIT」。「To eat shit」是俚語，指不小心撞上堅硬表面，通常是臉先著地，而這正是 Bugs 落地時發生的事。
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尼歐與祭師會面時，她公寓裡播放的背景音樂是金格·萊恩哈特的「Nuages」。這首曲子之後，可以聽到艾靈頓公爵的「I'm Beginning to See the Light」。
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尼歐在接受訓練時問莫菲斯：「你在說什麼，我能閃避子彈嗎？」莫菲斯回答：「不，尼歐。我的意思是，當你準備好了，你根本不必閃。」到了最後，尼歐成為救世主，只憑一個手勢就讓子彈停住。
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尼歐藏東西的那本書叫「Simulacra and Simulation」，是尚·布希亞的論著，探討後現代的擬仿與超真實概念。藏東西的那一章叫「On Nihilism」。虛無主義往往伴隨絕望感，以及認為生命毫無意義的信念。這本書也是所有主要演員在讀劇本前的必讀教材。
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尼歐常與數字 1 連結在一起。（Neo 是 one 的字母重組，而劇情的一大關鍵就是他究竟是不是「救世主」。）另一方面，賽佛的名字意指零（源自阿拉伯文 sifr）。零與 1 合起來代表二進位資料的基礎，也就是所有現代電腦資料的基礎。（尼歐也住在 101 號公寓，這個數字完全由這 2 個數字組成。）最後，崔妮蒂的名字意指「3 人一組」，而她初次登場是在 303 號房。
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莫菲斯讓尼歐在藍藥丸與紅藥丸之間做選擇時，藍藥丸在他左手，紅藥丸在右手。然而，當鏡頭以極特寫聚焦莫菲斯的臉時，他的墨鏡像鏡子般映出拿著藥丸的雙手，左右卻對調了，象徵現實可能具有欺騙性，「左」與「右」這類感知也可能逐漸消融。
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拍攝尼歐把史密斯砸向地鐵隧道頂部的那場戲時，基努·李維的替身查德·史塔赫斯基受了多處傷，包括肋骨斷裂、膝蓋受傷與肩膀脫臼。另一名特技演員則在尼歐被砸向售票亭的鏡頭中，被液壓牽引器弄傷。
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祭師向尼歐揭示他並非救世主後，對他說：「你有天賦，但看來你在等待什麼。也許是你的下一世吧。」這句話在電影結尾應驗：尼歐被史密斯殺死後，崔妮蒂讓他復活，終於使他成為救世主。
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所有探員程式的黑色西裝似乎都帶有金色內襯。這只有在奔跑與打鬥的場景才看得見。有趣的是，這或許是「程式」在駭客任務中能被某些擁有「視界」的人辨識出來的最早暗示，而這點直到電影之後才揭曉：最明顯的是在「Matrix: Reloaded」開頭，尼歐在獲准與祭師見面前，仔細打量了程式 Seraph。
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最後拍攝的一場戲，是尼歐第一次被拔掉插頭、沖入湖中的畫面。
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當Tank將武術訓練上傳給Neo時，畫面帶到電腦螢幕，正快速捲過各種武術流派。圖示上有人物的電腦影像，下方標示流派名稱。螢幕上第5個項目名為「Drunken Boxing」。本片的武術指導Yuen Woo-Ping，曾擔任Jackie Chan早期代表作Drunken Master（1978）的導演兼武術指導，片中Chan飾演的角色精通Zui Chuan，也就是醉拳。其他被下載的武術流派還包括柔術、法國踢腿術、拳法、跆拳道，當然還有功夫。
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當Neo在咖啡店與Tiffany交談時，他低頭一看，她的倒影竟是1名留著長髮的金髮女子。當Neo與他的諮商師（Neil Patrick Harris飾演的角色）說話時，鏡頭橫搖過第1扇窗，窗外是城市景觀；第2扇窗則是山景，這是駭客任務中的1個程式錯誤。
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Neo的辦公室裡擺著駭客任務三部曲中幾位角色的公仔，包括Morpheus、Trinity和1隻Sentinel Squid。另外還有1隻比中指的手，這是向第1集審問場景致敬，當時Neo也對Agent Smith比出同樣的手勢。
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Neo的名字與the One由相同的字母組成，只是排列順序不同，是1個重組字。
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當Neo問Choi：「你有沒有過那種感覺，不確定自己究竟是醒著還是在作夢？」Choi回答：「嗯，一直都有。那叫Mescaline。那是唯一能飛的方法。嘿，我聽起來你只是需要拔掉插頭，老兄。」這預示了Neo在片中的命運：他不只從駭客任務中被拔掉插頭，到了結尾他甚至能夠飛翔。
