Indiana Jones：140 則幕後冷知識
麥斯·米基遜是第2位既演過詹姆斯·龐德系列主要反派、又演過印第安納瓊斯系列主要反派的演員，他在《007首部曲：皇家夜總會》（2006）中飾演勒契夫。第1位是朱利安·葛洛佛，他在《最高機密》（1981）中飾演亞里斯多德·克里斯塔托斯，並在《聖戰奇兵》（1989）中飾演華特·唐納文。特別值得一提的是史蒂芬·卡利法，他在《最高機密》中飾演小反派赫克特·岡薩雷斯，並在《聖戰奇兵》中飾演一名無名的坦克駕駛員。強納森·普萊斯爵士在《明日帝國》（1997）中飾演艾略特·卡佛，並曾被考慮在《法櫃奇兵》（1981）中飾演貝洛克。此外，菲比·沃勒-布里奇曾擔任《007：生死交戰》（2021）的編劇。片中福勒（米基遜飾）一度要求交出「cypher」，而「chiffre」的其中一個英文翻譯正是「cypher」。
當兩名劍客在懸崖上攻擊印第安納，他試圖重演《法櫃奇兵》（1981）「籃子場景」中的應對方式、伸手去拿槍時，會聽到一小段來自籃子場景的配樂。
印第安納在片頭交給伊頓少校與馬斯葛洛夫上校的聖經是一本古老的荷蘭文版本，翻開的是歷代志下第2章第5節，內容描述「耶和華約櫃被抬進神殿內殿的至聖所，安置在基路伯的翅膀之下」。
老亨利·瓊斯向小亨利「印第安納」·瓊斯提到，他們家的狗叫印第安納。喬治·盧卡斯養過一隻名叫印第安納的狗，正是印第安納·瓊斯名字的靈感來源。這隻狗也因其外型與體型，啟發了《星際大戰》系列中丘巴卡這個角色。而丘巴卡正是韓·索羅的搭檔，韓·索羅同樣由哈里遜·福特飾演。
當印第安納提到自己被潘喬·維拉綁架時，他指的是由史恩·康納萊主演的《The Adventures of Young Indiana Jones: Spring Break Adventure》（1999）。
湯姆·謝立克是史蒂芬·史匹柏心中印第安納一角的第2人選。他的首選是哈里遜·福特，但喬治·盧卡斯反對，因為福特已演過他先前的賣座片《美國風情畫》（1973）、《星際大戰四部曲：曙光乍現》（1977）與《星際大戰五部曲：帝國大反擊》（1980），所以他想換個人來演。謝立克無法接演，是因為他已承諾演出《Magnum, P.I.》（1980）。然而，該劇直到《法櫃奇兵》拍攝結束後才開拍。事實上，謝立克當時人就在夏威夷等待影集開拍，而《法櫃奇兵》最後拍攝的場景（開場戲）正是在夏威夷取景。《Magnum, P.I.》（1980）後來拍了一集名為Legend of the Lost Art（1988）的內容，惡搞《法櫃奇兵》，帽子、鞭子和陷阱一應俱全。不用說，若由謝立克演出這個角色，他肯定會留著八字鬍。謝立克在這段期間確實主演了一部「法櫃」類型的電影，那就是《High Road to China》（1983）。
被問到哈里遜·福特是否太老、不適合再演印第安納時，製片法蘭克·馬歇爾引用《法櫃奇兵》（1981）的台詞：「問題不在年歲，而在里程。」他解釋，看到印第身處另一個年代會很有意思。年齡也讓瓊斯成為一個會犯錯、因而更可信的角色。福特每天在健身房待3小時，並以魚和蔬菜為主的高蛋白飲食維持體態，讓身體狀況足以親自完成特技（他本來就一直保持健身，因為他希望拍完1980年代原定計畫的全部5部印第安納瓊斯電影）。史蒂芬·史匹柏後來表示，他對福特的體態印象深刻到分不出第3部和第4部電影的拍攝畫面。
本片對馬可斯·布洛迪（已故的丹賀姆·艾利洛）有多處致敬：院長查爾斯與印第安納談話時，走廊牆上掛著他的肖像；印第安納桌上放著他的照片，旁邊是老亨利·瓊斯（史恩·康納萊爵士）的照片；學院校園裡還有一座馬可斯的雕像，是KGB探員意外把車開去撞上的。牌匾上寫著「光榮紀念馬可斯·布洛迪，1939至1944年學生事務長，以榮譽與忠誠任職」。
哈里遜·福特（印第安納·瓊斯）與派特·羅奇（蓋世太保）是唯二在前3部電影中都登場的演員。羅奇在《法櫃奇兵》（1981）中飾演巨型雪巴人與第一技工，並在《印第安納瓊斯：魔宮傳奇》（1984）中飾演侍衛長。原本拍了一場印第安納·瓊斯在飛船上把他打昏的戲，延續這個系列中福特角色每集都打倒羅奇角色的老梗。然而這場戲最終未採用，所以羅奇在本片僅存的畫面，就是他跟在沃格爾身後跑向飛船的那個鏡頭。這也是羅奇參與的最後一部系列電影，他於2004年過世。
他下巴上有一道疤，是1968年他一邊開車一邊想「繫安全帶」、結果失控所造成的。這道疤曾在他的2部電影裡被解釋過：在《聖戰奇兵》（1989）瑞凡·費尼克斯的開場戲中，經驗不足的年輕印第第1次嘗試用鞭子時打中了自己的下巴；而在《Working Girl》（1988）中，他先說這道疤是刀戰留下的，後來才坦承實情是他穿耳洞時昏倒、下巴撞上馬桶所致。
印第那件傷痕累累的皮夾克其實是全新的，還得靠服裝部門人工做舊。全片共有10件夾克，分別供日常磨損與特技演出使用。
馬歇爾學院那場戲裡，黑板上可以看到《魔宮傳奇》（1984）中桑卡拉聖石的照片，旁邊還寫著幾位與聖石有關的角色名字。
印第安納（哈里遜·福特飾）桌上顯眼擺著馬可斯（丹賀姆·艾利洛飾）與老亨利瓊斯（史恩·康納萊爵士飾）的照片，兩張都出自《聖戰奇兵》（1989）。較難察覺的是印第安納家中壁爐架上，放著一張他與薩拉（約翰·萊斯-戴維斯飾）在《法櫃奇兵》（1981）的合照。印第安納與馬特威廉斯（西亞·李畢福飾）交談時，背景的櫃子上還能看到《魔宮傳奇》（1984）中威莉史考特（凱特·卡普蕭飾）的照片，她身上穿的正是歐比王夜總會那套紅色舞台裝。史丹佛斯院長（吉姆·布洛班特飾）走進房間時，小桌上也短暫出現一張經過合成處理、年輕史恩·康納萊爵士與瑞凡·費尼克斯的合照。
印第向艾爾莎說明牆上雕刻指的是約櫃時，《法櫃奇兵》的約櫃主題曲會響起幾秒鐘。
根據DVD收錄的特效紀錄片中喬治·盧卡斯的訪談，巨大食人蟻的構想是直接取自《聖戰奇兵》（1989）一份遭棄用的劇本。
印第安納的招牌帽子、夾克與長鞭目前收藏於史密森尼美國國家歷史博物館。拍攝《印第安納瓊斯：水晶骷髏王國》（2008）期間，這些物件仍持續展出，因為劇組為戲服道具製作了大量複製品。
《法櫃奇兵》（1981）早期的一版劇本中，印第安納瓊斯曾遠赴上海尋回一根拉之杖的部件。他從收藏該物的博物館逃脫時，躲在一面巨大的滾動銅鑼後方閃避機槍掃射。同一版劇本還寫了印第安納與瑪莉安在礦車追逐中逃離毀滅的場面。這兩場戲都從該版劇本中刪去，後來卻在本片中重見天日。
印第被拖到行進中的卡車底下、再從車後被拖出來，這是向約翰·福特《驛馬車》(1939)中Yakima Canutt的著名特技致敬。事實上，這正是特技演員Terry Leonard前一年在《The Legend of the Lone Ranger》(1981)中未能成功完成的特技。能有機會再試一次讓他興奮不已，但他只肯在好友兼同僚Glenn Randall, Jr.負責開車的前提下答應演出。那輛卡車經過特別打造，底盤離地比一般卡車更高，好讓印第安納瓊斯能安全從車底通過，路面中央也特別挖空。在《Great Movie Stunts: 法櫃奇兵》(1981)中，從場記板可見攝影機是以每秒20格拍攝，而非傳統的每秒24格。換句話說，這些鏡頭是以「快動作」拍成，卡車實際上並沒有銀幕上看起來那麼快。部分鏡頭中，哈里遜·福特是真的被拖在卡車後方，肋骨因此嚴重瘀傷。被問到是否擔心時，福特打趣說：「不會。如果真的很危險，他們會先多拍一些其他戲。」追逐戲中，哈里遜·福特接連解決了他的3位特技替身，3人全都飾演德國士兵。Terry Leonard飾演卡車司機，被福特一拳打出駕駛座。Vic Armstrong與Martin Grace則飾演攀在卡車車側的士兵，隨後被打落。
印第安納與艾爾莎在威尼斯地下墓穴發現牆上約櫃圖像時，約翰·威廉斯會插入《法櫃奇兵》（1981）中約櫃的主導動機。
史恩·康納萊爵士始終是史蒂芬·史匹柏心目中飾演印第安納瓊斯父親的第一人選，這是個內部玩笑，意在暗示詹姆斯·龐德是印第安納瓊斯的父親。若此計畫不成，格里高利·派克、克里斯多福·普拉默與喬恩·珀特維是備選人選。史匹柏一直想拍一部龐德電影，卻把印第安納瓊斯塑造成詹姆斯·龐德型的角色。呼應龐德主題，本片有許多龐德電影的熟面孔同台：約翰·萊斯-戴維斯、艾莉森·杜迪、朱利安·葛洛佛、史蒂芬·卡利法、派特·羅奇、尤金·李平斯基、邁克爾·伯恩與維納恩·多切夫。
印第安納瓊斯飛往尼泊爾所搭乘的泛美水上飛機，是一架經遮罩特效修改、用來冒充馬丁M-130「中國快艇號」的肖特索倫特Mark III型飛艇。製片曾聯絡這架飛艇的船主，詢問能否借來拍片；對方雖表示樂意幫忙，卻告知飛艇只有1具引擎修復到可運轉狀態，因此片中出現的鏡頭裡只看得到那1具引擎在運轉。此外，為了呈現這是客機，史匹柏安排幾位穿著時代服裝的製片助理，單純拍他們走過機艙門口。
在劇本裡，Marion告訴Indiana她靠在那間酒吧工作才活了下來，「而且我不是酒保。」喬治·盧卡斯在劇本會議上建議：「她一開始可能是唱歌的，或是當應召女郎之類的。後來她買下了經營那家店的傢伙，不然就是那人死了。」
和Short Round、Indiana Jones一起關在籠子裡、喊著「我向濕婆祈禱，讓我死吧」的那個小孩，是由未掛名的Tress MacNeille配音。
Cate Blanchett和哈里遜·福特在這部片之前從未見過面。兩人第一次被介紹認識，正是在拍攝首日、也就是Indiana與Spalko初次相遇的那場戲。Blanchett說，以Indiana Jones的裝扮被介紹給他認識再理想不過，因為她一直是這個角色的忠實粉絲。
當Jones博士跑進試爆場那棟房子的客廳時，他身後書架上的架上擺著一只高腳杯，模樣神似《聖戰奇兵》(1989)裡的聖杯，只是尺寸更大，而且材質是石頭而非木頭。
Henry和Indy第一次與最後一次的對話一模一樣：Henry喚Indy為「Junior」，Indy則回答：「是的，先生。」
這是Ke Huy Quan的電影處女作。劇組向所有小學發出公開選角通知，尋找能飾演Short Round的年輕亞裔演員。Quan陪哥哥前來，並非為了試鏡，純粹是去精神支持。他之所以引起選角導演的注意，是因為哥哥試鏡的整段時間裡，他都在一旁指點哥哥該做什麼、不該做什麼。史蒂芬·史匹柏喜歡他的個性，於是他和哈里遜·福特即興演出了Short Round指控Indy在牌局中作弊的那場戲。Quan擊敗約6,000名其他試鏡者，拿下這個角色。
哈里遜·福特回顧本片的票房失利時說：「這種鳥事難免。我才是那個覺得還有故事可講的人。當[Indy]承受了他不得不那樣過的人生所帶來的後果，我想再有一次機會把他扶起來、拍掉他屁股上的灰塵，把他推出去，讓他少了幾分活力，看看會怎樣。我還是很高興自己拍了那部片。」
通往集會講台前的告示牌寫著「Staff Officers only」（德文「Nur für Stab(s)offiziere」，意指少校或以上軍階），這大概就是Indiana為何選擇那套相當顯眼的上校制服的原因。
James Mangold說喬治·盧卡斯「讀過我們早期的劇本，提供意見與指導，也隨著剪輯進度觀看毛片。」他補充：「Indy是George自身人格的深刻延伸——一半是特立獨行者，一半是理論家，一半是冒險家，一半是理想主義者，一半是耍嘴皮子的傢伙，一半是學者，而且100%擋不住。」
Indy最經典的台詞之一，是他在本片對Elsa說的：「納粹。我恨死這些傢伙了。」哈里遜·福特擁有德國與俄裔猶太血統，這讓他與納粹在歐洲迫害猶太人的歷史有著切身的連結。
史蒂芬·史匹柏希望Karen Allen回歸飾演Marion Ravenwood，但他和喬治·盧卡斯早已決定每部電影都要讓Indiana身邊有不同的女人。不過這項慣例後來有了改變，她最終在《印第安納瓊斯：水晶骷髏王國》(2008)回歸。史匹柏和盧卡斯覺得時間已過得夠久，對第4部片來說，舊情人更為合適。
在電影開頭幾分鐘，印第安納·瓊斯提到自己只在「特殊場合」才講中文。這其實是巧妙的伏筆，因為片尾印第安納·瓊斯必須用中文警告小圓帽抓緊繩橋，他正準備把橋砍斷。要是他用英文警告小圓帽，就會讓邪教徒識破他的意圖。而這顯然就構成了所謂的「特殊場合」。
他飾演的韓索羅與印第安納·瓊斯，分別在《星際大戰五部曲：帝國大反擊》（1980）和《魔宮傳奇》（1984）中慘遭嚴刑拷打，而這兩部正好都是各自三部曲的第2集。
從他收到來自義大利的包裹上的地址可知，印第安納在巴奈特學院任教。這所學院的名字後來被沿用，並在《亞特蘭提斯之謎》（1992）等後續作品中更為突出。
他在拍攝《魔宮傳奇》（1984）時背部受傷，接受了當時尚屬實驗性的椎間盤手術，用上了木瓜酵素。在他休養期間，史蒂芬·史匹柏盡可能繞著他拍，包括大部分輸送帶場景，並找來英國出身的特技演員維克·阿姆斯壯代打；此人長得極像哈里遜·福特，劇組人員經常把兩人搞混。福特復原後便恢復親自上陣，他的特寫鏡頭則是後來才補進完成版電影裡。
編劇大衛·柯普在《娛樂週刊》的訪問中證實，由西亞·李畢福飾演、於《印第安納瓊斯：水晶骷髏王國》（2008）登場的亨利·「馬特」·華頓·瓊斯三世，這回不會出現在片中。柯普並未說明這個角色與李畢福為何不參與，但外界普遍認為主因是馬特這個角色和李畢福都招來影評與觀眾的負評、李畢福隨後幾年極度公開的爭議行為，以及他對與《水晶骷髏王國》導演史蒂芬·史匹柏合作的負面評論（他後來為此道歉）。共同編劇兼導演詹姆斯·曼高德後來澄清，最後這點其實並非決定刪去馬特的原因，並解釋說他只是想把焦點放在印第與海倫娜之間「美妙的化學反應」，也覺得片中角色已經夠多了。
村中長老向印第講述他們的故事時，印第雙手交疊；小圓帽接著有樣學樣，也把自己的手交疊起來。這與《大白鯊》（1975）中布洛迪警長和兒子的橋段相似，而該片同樣是史匹柏的作品。
印第開槍擊斃那名囂張跋扈的刀客，這場著名戲碼原本不在劇本裡。原本的安排是哈里遜·福特用鞭子把對方手中的刀捲走，但他和劇組其他人食物中毒，病得無法完成這個特技。試了幾次都不成功後，福特提議「乾脆把那傢伙斃了」。史蒂芬·史匹柏當場採納，這場戲便順利拍成。
史蒂芬·史匹柏面臨的難題，是史恩·康納萊（老亨利·瓊斯，1930年生）與哈里遜·福特（印第安納，即小亨利·瓊斯，1942年生）只差12歲。因此劇組必須確保史恩始終留著白鬍子，讓他看起來老得多，動作也放慢、顯得沉思；哈里遜則得保持刮乾淨鬍子，看起來年輕些，動作也要更敏捷、更有活力。
逃離俄軍帳篷營地時，印第安納·瓊斯說了一句「這太令人無法忍受了！」，而這句話正是老亨利·瓊斯在《聖戰奇兵》（1989）裡說過的。
哈里遜·福特提名瑞凡·費尼克斯飾演年輕的印第，兩人先前曾在他眾多作品中最鍾愛的《蚊子海岸》（1986）合作過。談到如何準備這個角色時，費尼克斯解釋，他其實不是以印第安納·瓊斯這個角色為藍本，而是以哈里遜·福特本人為依據，所以他在開拍前先觀察了卸下角色身分的福特。
史恩·康納萊爵士被選來演印第安納的父親絕非巧合。原因之一是印第安納·瓊斯系列大量借鏡老冒險片，就像兒子會從父親身上遺傳特質一樣。康納萊傳承下來的特質正是詹姆斯·龐德，因為龐德總能找到荒謬至極的方式逃離生死關頭，就像本片的坦克橋段，或《魔宮傳奇》（1984）裡的雪橇橋段。
劇組曾邀請史恩·康納萊爵士客串演出印第安納的父親老亨利·瓊斯，但他婉拒了，覺得退休生活實在太愜意。喬治·盧卡斯後來表示，事後看來，老瓊斯沒有登場是好事，否則觀眾發現他沒跟著一起冒險時會失望。哈里遜·福特也開玩笑說，自己已經老到可以演自己的父親，不再需要史恩了。
這是《印第安納瓊斯》系列中唯一一集印第沒有實際碰到蛇的作品。不過片中仍向他怕蛇這件事，以及《法櫃奇兵》(1981)的一場戲致意。他從卡莉神殿取回桑卡拉石後，抬頭看見一尊作勢攻擊的眼鏡蛇雕像（就像他在《法櫃奇兵》「靈魂之井」那場戲裡著名面對的那條蛇），並扶正了自己的帽子。在營火那場戲裡，威莉把一條蛇誤認成象鼻，她一把抓起、嫌惡地丟到一旁，而印第明顯被那條蛇嚇到。
片頭不久，印第被隔壁公寓傳來的音樂聲吵醒，他匆匆套上一件T恤——還是穿反的——就跑去理論。那件T恤正面（穿在他背上）的幾個鏡頭裡，有個明顯是芝加哥小熊隊的隊徽。片中當時是1969年8月，芝加哥小熊正是全聯盟戰績最好的球隊，但最終後繼無力，沒能打進世界大賽。儘管如此，1969年的小熊隊在球迷心中仍是隊史最為人津津樂道的隊伍之一。哈里遜·福特是芝加哥本地人，也是出了名的小熊迷，那個球季他正好27歲。
史蒂芬·史匹柏與喬治·盧卡斯對印第安納瓊斯這個角色的看法並不一致。盧卡斯把他視為007式的花花公子，史匹柏與勞倫斯·卡斯丹則認為，這個角色兼具學者與冒險家兩種特質，已經夠複雜了。史匹柏對瓊斯的想像更陰暗，把他詮釋成酒鬼，類似《碧血金沙》(1948)裡亨佛萊·鮑嘉飾演的弗雷德·C·多布斯。這樣的設定在後來的劇本草稿中逐漸消失，不過仍留有痕跡（尤其是瓊斯對瑪莉安「死訊」的反應）。
一份後來發展成《印第安納瓊斯：水晶骷髏王國》(2008)的未拍攝劇本裡，印第曾透露威莉的下落，說：「我最後聽說，她嫁給了一位大牌導演。」這是個內部笑話，因為凱特·卡普蕭嫁給了史蒂芬·史匹柏（不過這個笑點並未寫進最終稿）。
按照最初的劇本，印第安納與馬可斯在華盛頓特區會見陸軍情報官員的那場戲之後，緊接著就是方舟被送進倉庫的畫面。是瑪西亞·盧卡斯（一位資深剪接師）向導演史蒂芬·史匹柏以及她當時的丈夫、編劇兼製片喬治·盧卡斯指出，印第安納與瑪莉安的關係沒有交代，這部片「需要那一點收尾」。於是補寫了一場戲，並在舊金山市政廳的階梯上拍攝。
印第的帽子製作時，帽簷的形狀特意設計成能遮住他的眼睛以提供保護，也方便在起用替身演員時遮住臉孔。
他起初反對在《聖戰奇兵》(1989)中找史恩·康納萊飾演自己的父親，因為康納萊只比他大12歲。後來他改變了主意，並發現與康納萊合作愉快極了。
服裝設計師黛博拉·納杜曼以《Secret of the Incas》(1954)中卻爾登·希斯頓的造型為藍本，設計了印第的服裝、飛行夾克與軟呢帽。在那部片中，希斯頓飾演一名尋寶冒險家，他研究了一座古老的「地圖室」模型後，利用水晶反射的陽光光束定位出寶藏所在。片中希斯頓還駕駛一架被劫持的飛機，並搭乘黃色充氣橡皮艇順流而下，令人聯想到《印第安納瓊斯：魔宮傳奇》(1984)的情節。
哈里遜·福特堅持要親自揮舞印第安納那條著名的鞭子。派拉蒙高層因為新的電影安全規範，希望這項武器以電腦動畫生成，但福特直斥這項規定「荒謬」。
故事背景設定在1957年。印第被迫在51號機庫尋找一件物品時，片中提及俄羅斯人正在找他10年前發現的某樣東西。這指的是1947年那起惡名昭彰的事件，有人聲稱真有外星人在附近墜毀，並被軍方掩蓋。印第向聯邦調查人員陳述的經過，也印證了他當年涉入此事有多麼保密。
在礦車追逐那場戲裡，可以聽到小圓圓叫印第走「左邊的隧道」，但印第安納卻走了右邊。左邊（安全）的隧道是藍色，右邊（不安全）的隧道是紅色，仿效《星際大戰》系列中藍色（代表正義）與紅色（代表邪惡）的光劍顏色。喬治·盧卡斯參與了這兩套系列電影，而《印第安納瓊斯》系列也充滿了《星際大戰》的內部笑話。
喬治·盧卡斯最初對印第安納搭檔的構想是一位清純的年輕公主，但威拉德·赫依克、葛洛莉亞·卡茲與史蒂芬·史匹柏都不喜歡這個點子。
印第安納的袋子被坦克砲管勾住、沿著牆壁被拖行時，並沒有使用特技替身，而是哈里遜·福特親自上陣。工作人員只是拿著鏟子跟在旁邊，從上方把泥土和黏土倒在他身上。
在威尼斯圖書館裡，印第翻開父親的筆記本，把彩繪玻璃窗與書中的圖樣對照。印第右手拇指壓著的那張紙上寫了好幾行文字，描述第一次世界大戰期間結婚率下滑的情況，以及戰後結婚率回歸正常的預測。
在本片的幕後花絮紀錄片中，喬治·盧卡斯表示，雖然他原本打算讓《魔宮傳奇》的調性比《法櫃奇兵》(1981)更黑暗（就像《星際大戰五部曲：帝國大反擊》(1980)比《星際大戰》(1977)更黑暗一樣），但他坦承自己把它拍得比預期黑暗得多，部分原因是當時他和史蒂芬·史匹柏都正經歷分手，而他「心情不太好」。史匹柏也坦言，雖然他認同盧卡斯想拍一部調性更黑暗的電影，但拍攝某些場面時仍感到不自在，於是會試著在那些場面中加入一些幽默元素，讓氣氛輕鬆些。印第拿著鐵鎚與Thuggee首領侍衛搏鬥，侍衛奪走鐵鎚扔到一旁，鐵鎚卻落到一名旁觀者頭上，隨著一聲滑稽的悶響把他打昏，這場戲正是這種「緩和氣氛」的典型例子。
當亨利對印第會開飛機表示驚訝時，印第安納回答：「開，會。降落，不會。」這是在影射他在《魔宮傳奇》（1984）中墜機的事。
湯姆·斯托帕德爵士受酬12萬美元改寫對白，特別是亨利的台詞以及亨利與印第安納的對話。本片上映並大獲成功後，他又額外獲得100萬美元作為獎金。在2006年《Empire》雜誌刊出的〈The Last Crusade: An Oral History〉一文中，史匹柏談到「小亨利」與「老亨利」的對話時說：「這是個充滿情感的故事，但我不想流於濫情。他們父子之間的疏離是許多喜劇的基礎，也給了未掛名的湯姆·斯托帕德很大的發揮空間。幾乎每一句對白都出自湯姆之手。」
電影開頭，亨利「印第安納」瓊斯二世教授（哈里遜·福特）在課堂上授課時說：「如果你感興趣的是真理，泰瑞博士的哲學課就在走廊那頭。」這是在影射福特自己在大學時的老師威廉·E·泰瑞博士；福特主修哲學，就讀於威斯康辛州里彭的里彭學院。
瑞凡·費尼克斯是首位飾演少年印第安納瓊斯的演員。這段以少年印第為主的開場戲，啟發了喬治·盧卡斯創作電視影集《百勝天龍：少年印第安納瓊斯》（1992）。費尼克斯曾被邀請在該影集中飾演少年印第，但他拒絕了，因為不想重返電視圈，於是改由西恩·派翠克·福納瑞出演。
片尾名單中名為「Fedora」的角色（由理查·楊飾演），在劇本裡原本叫阿布納·雷文伍德，也就是瑪麗恩·雷文伍德的父親、印第安納的恩師，這個角色曾在《法櫃奇兵》（1981）以及後來的《印第安納瓊斯：水晶骷髏王國》（2008）中被提及。
在印地於臥室遭圖吉刺客襲擊的那場戲中，哈里遜·福特把特技演員比爾·里德翻過背上時，導致背部椎間盤突出，製作因此停擺，福特被送往洛杉磯接受脊椎手術。福特在《魔宮傳奇》打鬥與追逐戲中的大部分演出，其實是由特技演員維克·阿姆斯壯代為完成。一般來說，必須特別小心不讓特技演員的臉被鏡頭拍到，但這回幾乎不必費心，因為阿姆斯壯當時的長相與體型都和福特極為神似。
印地安納瓊斯在這部片中並沒有說出他的招牌台詞「相信我」，說這句話的是瑪莉安·瑞文伍德。不過，他倒是說了「我對這件事有不好的預感」，這句台詞經常出現在星際大戰 (1977) 的角色口中。韓·索羅正是由哈里遜·福特飾演。
印地在歐比王俱樂部與老崔會面時想取得的鑽石，正是「孔雀之眼」；一次世界大戰結束後，年輕的印地與好友雷米·波杜安便是在前傳影集《The Young Indiana Jones Adventures》第18章中追尋這顆鑽石。
史蒂芬·史匹柏原本計畫把坦克追逐戲拍成2天內完成的短段落，但他後來繪製分鏡圖，把這場戲打造成動作場面的重頭戲。他認為自己無法超越《法櫃奇兵》(1981) 的卡車追逐（因為卡車比坦克快得多），因此覺得這段戲應該更著重於劇情，必須展現印地與亨利互相扶持。他後來表示，畫這段戲的分鏡圖比實際拍攝更有趣。
許多影迷對於瓊斯一行人選擇重返礦坑、而非與其他逃脫的俘虜一起從潘科特宮離開感到不解。其實劇組曾拍了一場解釋性的戲，顯示印地和威莉協助獲救的孩子們走過臨時搭起的橋，跨越熔岩坑。輪到短圓過橋時，橋面已因高溫起火，印地和威莉在千鈞一髮之際救了他，沒讓他掉進熔岩坑。橋樑崩塌後，3人只得另尋出路，也就是穿過礦坑。這段戲被剪掉，最合理的解釋似乎是節奏考量，而非片長問題，因為全片最終長達1小時53分鐘；即使把本文提到的所有場景全都加回去，也無法讓片長突破2小時大關。
片中向其他電影致敬的橋段不少。其中最著名的2處，一是印地掏出鞭子，卻面對滿屋子拔槍相向的人，這是對他當年與劍客對峙、隨後開槍擊斃對方那場《法櫃奇兵》(1981) 經典戲碼的半個反轉。較少人熟悉的一處，則是印地強行開走選美皇后的車，這很可能是在向約翰·貝魯西在《動物屋》(1978) 中的經典演出致敬，該片同樣由凱倫·艾倫主演。
逃離布倫瓦德城堡、甩開騎摩托車的納粹士兵後，印地與父親來到一處岔路，路標顯示左方（北）通往柏林，右方（南）通往威尼斯。同一塊路標上還有一個幾乎看不清的第3個城市，指向瓊斯父子來時的方向，標示的是通往加米施-帕滕基興的道路，該地曾主辦1936年冬季奧運。
他推薦瑞凡·費尼克斯出演《聖戰奇兵》(1989) 中年輕印地安納瓊斯的角色。福特與費尼克斯先前曾在《The Mosquito Coast》(1986) 中飾演父子。
克里斯·哥倫布寫了幾版草稿。他1985年5月3日完成的第一版暫名為「Indiana Jones and the Monkey King」，主線圍繞蟠桃園展開。故事從1937年說起，印第安納在蘇格蘭度假，與殺人如麻的Baron Seamus Seagrove三世幽靈交手。之後他前往莫三比克，協助Dr. Clare Clarke（喬治·盧卡斯形容她是凱瑟琳·赫本那一型的女性），她發現了一名200歲的矮人族Tyki Tyki。這名矮人持有1卷地圖，指引通往猴王孫悟空失落之城的去路。據說猴王的果園長著能賜永生的果實，因此由綽號Lieutenant Werner Von Mephisto的魁梧軍官率領的納粹也對這座城虎視眈眈。一行人搭船前往途中，矮人遭Mephisto手下Sergeant Helmut Gutterburg率領的納粹綁走，這名士官的手臂是機槍，還駕駛1輛3層樓高的坦克逃逸。印第安納、Clare與印第安納的故交Scraggy Brier沿三比西河而上將他救回。抵達失落之城城門時，他們發現守衛是猩猩，但Tyki設法說服牠們，讓眾人免於受傷。納粹趕到後，雙方與猩猩爆發大戰，猩猩還奪下1輛坦克，印第安納則騎著1頭巨大犀牛參戰。高潮一戰中，印第安納遭Mephisto擊斃，Mephisto則跌入虎坑，而猴王（半人半猴的骷髏形體）以果園的1枚果實救活印第安納。最後印第安納帶著Dr. Clarke及猴王所贈、能變形的法杖離去。其他角色還包括1個食人非洲部落；Betsy，1名偷渡的學生，對印第安納痴戀到想尋死；以及Kezure（設定為三船敏郎型人物）率領的1幫海盜，他因心術不正，吃桃時斃命。哥倫布1985年8月6日的第2版刪去Betsy，加入流亡酒吧老闆Dash（納粹替他做事），並改由猴王當反派。猴王逼印第安納與Dash以真人當棋子下棋，每被吃掉1人便化為灰燼。印第安納隨後大戰不死軍團，摧毀猴王的法杖，並娶了Clare。勘景已在非洲展開，但史蒂芬·史匹柏與盧卡斯最終放棄「Monkey King」，原因是對非洲原住民的負面描寫，以及劇本太過脫離現實。史匹柏坦言這題材讓他「覺得自己很老，老到導不動」。不過本片的坦克追逐戲，以及能賜永生的寶物這個主題，都取自他的其中1版草稿。芝加哥播客Alcohollywood的成員自2017年初起，定期把1版早期劇本以分集廣播劇形式發表。
看著印第安納與Vogel上校扭打，潛望鏡旁的士兵用德語對同伴說：「Die Amerikaner, die kämpfen wie Weiber」（「美國人！他們打起架來像娘兒們！」）。
在耶魯舉行的前期製作記者會上，製片法蘭克·馬歇爾表示，印第安納虛構的Marshall College確實是以他命名。他打趣說：「要是我姓Yale，那就是Yale College了。」
劇本寫明Marion 25歲。喬治·盧卡斯原本想把她設定得更年輕，但史蒂芬·史匹柏在劇本會議上反對這個年齡。盧卡斯說：「一旦她16、17歲就沒那麼有趣了。可是……她當時15歲，他（印第安納）25歲，他們上次見面時真的有一腿。」勞倫斯·卡斯丹沒把她的年齡寫進對白，只讓Marion對印第安納說：「這10年來我學會了恨你……我當時還是個孩子！」
喬治·盧卡斯與史蒂芬·史匹柏討論第3部印第安納瓊斯電影時，想把背景設在1棟鬼屋。史匹柏才剛拍完《鬼哭神號》（1982），決定換點不一樣的題材。盧卡斯於是提出聖杯的構想，史匹柏再補上父子親情這條支線。
飾演德國卡車司機的替身，也替印第安納完成多場特技，包括從馬背跳上卡車，以及滑進卡車車底。
Pat Roach在《法櫃奇兵》中飾演那名留八字鬍的禿頭巨漢納粹技工，與Indy拳腳相向，最後被飛機螺旋槳絞碎。Roach在《法櫃奇兵》裡還分飾多角；事實上印第安納瓊斯4部曲他每1集都亮相。每當史蒂芬·史匹柏需要1個莽漢、1隻巨怪，或某個特大號人物來惹麻煩，他就是史匹柏的首選。
他在1次訪談中表示，印第安納瓊斯3部曲讓他非親自上陣不可，因為這些電影非常「動作導向」，他覺得自己若不身處動作核心，就真的沒什麼事可做了。
3位主要角色的名字都取自狗。Short Round的名字來自編劇Willard Huyck的狗，而那隻狗本身又是以《The Steel Helmet》(1951)中的孤兒命名。Willie的名字來自史蒂芬·史匹柏的狗，印第安納則來自喬治·盧卡斯的狗。
與其他印第安納瓊斯電影一樣，哈里遜·福特親自上陣演出了許多特技。據特技演員Vic Armstrong表示，他不得不把福特拉到一旁，請他讓自己「做點工作」，因為福特親自包辦了太多動作場面。Armstrong後來說道：「如果他不當這麼出色的演員，一定會成為非常優秀的特技演員。」
當海倫娜與印第進入戴歐尼修斯之洞時，兩人唱起路德維希·范·貝多芬第5號交響曲（C小調，作品67）的開頭，以測試洞穴內的回音。選用這段音樂再合適不過，因為第5號交響曲正是以4個音符（滴-滴-滴-咚）揭開序幕，也就是所謂的「命運動機」或「命運」，意指宿命「在敲門」。
有幾場戲，包括印第在木筏上初次瞥見巫師的那場，以及Willie試圖替大象噴香水的那場，都是在斯里蘭卡一處暱稱「Bo Derek之湖」的地點拍攝；《Tarzan the Ape Man》(1981)中多個令人難忘的段落先前也曾在此取景。
在第3集中，老亨利拿印第安納的暱稱開玩笑，提醒他他們「把狗取名為印第安納」。現實生活中，喬治·盧卡斯在70年代初期養了一隻名叫印第安納的狗，印第安納瓊斯這個角色正是以牠命名。事實上，有一天盧卡斯看見妻子開著旅行車駛入自家車道，他看著她停車，透過擋風玻璃，看見妻子坐在右側駕駛座，而他的狗印第安納則坐在左側座位上。他心想：「他們看起來就像機長和副機長。」這便成了《星際大戰》(1977)中韓·索羅與丘巴卡的靈感來源。所以，那隻名叫印第安納的狗，啟發了哈里遜·福特飾演的2個角色。
在Elstree製片廠拍攝期間，麥可·傑克森前來探班，當時他正為1988至89年「BAD」巡迴演唱會的歐洲場次待在倫敦。在備受爭議的HBO紀錄片《Leaving Neverland》(2019)中揭露，傑克森造訪片場時由Jimmy Safechuck陪同，這位前童星後來聲稱曾遭這位歌手性侵。Safechuck表示，造訪片場期間他曾與哈里遜·福特一起消磨時間，福特還讓他在拍攝空檔甩印第的長鞭。
Brody初次到印第家中商談任務時，瓊斯之所以是那身打扮，是因為他正在臥室裡招待一名年輕女子。劇本原本打算先讓她露面再轉到下一場戲，好讓印第多幾分世故風流的形象（像詹姆斯·龐德那樣）。然而她的戲份最後被剪掉，因為史蒂芬·史匹柏認為花花公子作風不符合印第的性格。（這也順帶說明了為何有幾名女大學生對他傾心不已，以及為何有個女孩在眼皮上寫了「愛你」）。
印第安納那句「I Like Ike」（測試城鎮上方的炸彈上也看得到）用的是彼得·G·彼得森（理查·尼克森的商務部長）為1952年「徵召艾森豪運動」所創的口號，那是史上第一個成功說服平民（德懷特·D·艾森豪）出馬競選總統的政治徵召行動。
詹姆斯·曼高德表示，他當初提案時為本片取的片名是「Indiana Jones and the Magical Mystery Tour」。片中可聽見披頭四1967年《奇幻之旅》的原聲帶。
劇本早先的版本裡，拿印第安納瓊斯年齡開玩笑的橋段比成片多出許多。主演哈里遜·福特對此不以為然，認為這些笑點會讓觀眾分心、偏離故事，因此年齡梗的數量大幅刪減。
在圖書館追逐戲中，印第回答一名學生的提問時說，做研究最好的方法就是走出圖書館。這似乎與他在《聖戰奇兵》（1989）裡給學生的建議相牴觸——他當時說「所有考古工作有70%是在圖書館完成的」。（在《聖戰奇兵》中，他「X絕不會、絕對不會標出地點」的說法同樣被推翻，所以印第或許覺得有必要從那時起改口。）
這是唯一一部既沒出現約櫃、也未提及約櫃的印第安納瓊斯電影。原因是本片時間設定在《法櫃奇兵》（1981）之前1年，當時印第還沒對約櫃產生興趣。不過隧道牆上倒是畫有約櫃的圖案。
拍攝印第安納開卡車撞穿牆壁那場戲時，情況並不如計畫順利。劇組使用了定時炸藥，但其中一枚沒有引爆，還落在哈里遜·福特旁邊的座位上。
史蒂芬·史匹柏的招牌主題：父親。小圓把印第安納瓊斯視為父親般的人物，而印第安納有時似乎不太願意回應這份情感。
這並非哈里遜·福特自《聖戰奇兵》（1989）後首次飾演這個經典角色。福特曾戴上軟呢帽、穿上夾克，在《Young Indiana Jones and the Mystery of the Blues》（1993）中短暫亮相，該故事的時間設定比本片早7年。喬治·盧卡斯正是在拍完那一集之後，開始著手開發第4部電影。
開場回憶片段中印第尋找的文物是朗基努斯之槍，也就是釘十字架時沾上基督鮮血的那把長矛。這件文物又名「命運之矛」，原本已被考慮作為《Indiana Jones and the Fate of Atlantis》（1992）續作遊戲的題材，但計畫始終未能實現，後來改於1995年漫畫《Indiana Jones and the Spear of Destiny》中登場，故事裡納粹覬覦這把長矛，印第與父親必須設法阻止他們。
哈里遜·福特多年來保養得宜，本片服裝尺寸與《聖戰奇兵》（1989）相比完全沒變。由於1989年以來特技技術變得更安全，他親自上陣完成了許多特技動作，也覺得這樣能讓自己的演出更出色。
守護聖杯的3道試煉由史蒂芬·史匹柏設計。第1道試煉中，印第安納像懺悔者般低頭閃過的刀刃，是吉布斯與光影魔幻工業製作的實體刀與縮小模型刀混合而成。第2道試煉裡，印第安納要在穩固的踏腳石上拼出「Iehova」，原本設計是他在誤踩「J」之後，會有1隻狼蛛爬上身。這段拍了卻不理想，於是光影魔幻工業改拍1名特技演員懸在地板破洞中、離洞窟底部30英尺高的畫面。由於畫面昏暗，即使遮罩繪景與模型是製作後期趕工完成也無妨。狼蛛版本則用在電影的漫畫改編中。第3道試煉是信仰之躍：印第安納發現強迫透視藏起的橋後，縱身躍過看似無法跨越的深谷，這段以模型橋搭配手繪背景完成，比搭建實景便宜。由於福特是對著藍幕拍攝，畫面中沒有入口射入的光束，劇組便用1具哈里遜·福特人偶在9英尺高、13英尺寬的模型上投出影子。
西亞·李畢福於2007年4月簽約接演本片，他興奮到連劇本都沒讀就答應演出印第安納瓊斯電影。為了詮釋油頭太保馬特·威廉斯，李畢福反覆觀看前3部印第安納瓊斯電影，以及《The Wild One》（1953）、《Rebel Without a Cause》（1955）和《Blackboard Jungle》（1955），還增重了15磅肌肉。
本片刪減片段：在烏鴉酒吧Indy與Marion未剪掉的對話中，Marion說明Abner的死因，並向Indy訴說自己這兩年來的艱難處境。安排妥隔天交付徽章之約後，Indy轉身離去，卻在Marion的催促下折返。她抓住他的外套，將他拉近親吻。整場烏鴉酒吧戲因被認為太長而遭刪除。親吻部分可在《The Making of Raiders of the Lost Ark》紀錄片中看到。這場戲也見於劇本草稿、小說版及Marvel Comics的電影改編漫畫。關於約櫃的一項劇情元素被刪去，僅在結尾約櫃開啟時略作暗示。基本上，最終剪輯版並未提及約櫃的2條規則：1. 碰觸約櫃者死。2. 約櫃開啟時直視者死。這最早是在Indy與Sallah拜訪伊瑪目那場戲的補充對白中說明。伊瑪目在翻譯頭飾上標明拉之權杖高度的文字前，警告Indy不可碰觸約櫃，也不可在約櫃開啟時直視。這條約櫃支線的下一個場景，是Sallah與Indy將約櫃從靈魂之井取出。Sallah初次見到約櫃時伸手想摸，Indy及時阻止，並提醒他伊瑪目的警告。接著他們將長桿穿過約櫃兩側，把它從墓穴中抬出。注意，此後直到結尾，片中始終沒有人碰觸約櫃。Indiana Jones在地圖室尋找靈魂之井確切位置時，2名德國士兵走向Sallah，命令他幫忙把陷在沙裡的卡車弄出來。過程中，Sallah弄丟了原本要幫Indy離開地圖室的繩子。接下來的場景中，Sallah走進德軍帳篷尋找可替代繩子的東西，過了一會兒，他弄來一條由床單與納粹旗幟製成的「繩子」。我們沒看到的是，Sallah在早餐時間驚慌失措地在納粹營地裡遊蕩。一群德國士兵要他從大鍋裡盛水給他們，Sallah把鍋中物灑在德國軍官的制服上，離去時承諾會帶清水回來。這場戲原本要在背景製造煙霧，但用來生煙的輪胎太多，畫面因此太暗。史蒂芬·史匹柏選擇刪掉這場戲，而不願花半天重拍。Indy與Marion被困在靈魂之井裡等死時，德軍決定處決Sallah。原定由1名年輕德國士兵執行這樁髒活，但他開始猶豫，事情就此生變。1名在突尼西亞度假的德國青年被雇來飾演這名年輕士兵。有趣的是，這個毫無經驗的年輕人竟出色地詮釋了年輕士兵被迫決定是否殺害無辜陌生人的道德困境。這正是對外戰爭的本質，而這個不知名的德國男孩傳達得毫不遜於任何演員。結果難以言喻，這名德國學生演出一場極度感人、情緒飽滿的戲，讓David Wisnievitz與Karen Allen稱之為開拍以來最偉大的時刻。史匹柏說，殘酷的事實是，這場戲雖出色難忘，卻可能終究難逃剪接室，因為它實在太長。果然如此。Indy與Marion逃出靈魂之井那場戲有段小刪減。Indy將大石磚推出滿是木乃伊的房間時，外頭站著1名阿拉伯守衛。阿拉伯人與Indy正面相對時，Indy直接把他打昏。這場戲的痕跡仍留在片中：Indy走出石室時稍作停頓，望向畫面左側；下一個鏡頭中，Indy與Marion從建築物跑向德軍飛機時，可見到那名阿拉伯人躺在建築物旁的地上。Indy用鞭子把自己綁在潛望鏡上，熬過潛艦航程。最終版電影中，這個劇情漏洞大致未被察覺。多數人似乎都假設Indy偷偷潛入潛艦，或潛艦整趟航程都留在海面上。這場刪減戲確實出現在Marvel Comics改編漫畫中。
導演印記（史蒂芬·史匹柏）：流星。在0:28:19，Indiana在山丘上與Short Round說話時。
為拍攝Indiana逃出神殿的場景，製作了一個直徑22英尺（7公尺）的玻璃纖維巨石。史蒂芬·史匹柏對美術指導Norman Reynolds實現其構想的效果大為驚豔，於是讓巨石在片中扮演更重要的角色，並要Reynolds讓巨石再多滾50英尺（15公尺）。
他在《魔宮傳奇》（1984）拍攝期間，冷不防跑上片中高潮戲所用的繩橋測試安全性，把導演史蒂芬·史匹柏和劇組嚇個半死。史匹柏後來打趣說：「我能說什麼？哈里遜真的是印第安納瓊斯。」
失望的影迷把「Nuke the Fridge」一詞引入英語口語，用來取代「Jump the Shark」，指的是印第安納瓊斯爬進冰箱而躲過核爆的那場戲。這兩個說法都形容一個系列已過巔峰、瀕臨荒謬。據大衛·柯普所言，冰箱這場戲早在法蘭克·達拉邦所寫的第3稿劇本就已存在，他非常喜歡，因此保留到最終稿。不過隨著時間過去，這場戲也逐漸獲得一些肯定，被視為系列的轉捩點；連科學家都研究過它，還有人把它拿來與《魔宮傳奇》（1984）的飛機段落相提並論。
印第安納告訴父親，他會開飛機，但不會降落。哈里遜·福特在現實生活中是經驗豐富的飛行員，還曾發生過2次墜機。
原本印第安納要對抗的是一場前納粹分子的起義，但史蒂芬·史匹柏在執導《辛德勒的名單》（1993）之後，覺得自己無法輕率處理納粹題材，哈里遜·福特也認為他們「把納粹用到徹底厭倦了」。喬治·盧卡斯同樣覺得1950年代這個背景必須考量冷戰，而當他聽說約瑟夫·史達林曾對水晶骷髏感興趣，便把蘇聯人寫成劇本中的反派。
那輛坦克時速只有10到12英里，維克·阿姆斯壯說，這讓拍攝印第安納騎馬對抗坦克、又要顯得速度很快的場面相當困難。
製作期間，本片開始超出預算，史匹柏於是去找編劇威拉德·赫克與葛洛莉亞·卡茲，請他們修改劇本以節省開支。他們從劇本刪掉1頁，省下100萬美元。那是一場原定以老式雙翼機拍攝的空中追逐戲。這場戲從片中刪除，後來被納入《聖戰奇兵》（1989）。
印第安納瓊斯所使用的那輛「兩棲通用車輛」是俄羅斯的GAZ-46。許多人誤以為它是二戰時美軍的GPA或兩棲吉普車。俄羅斯人仿製了許多二戰時的美國與德國車輛並加以生產，甚至到今天依然如此，例如多數傾卸卡車都是以租借給他們的Studebaker為基礎。
史蒂芬·史匹柏在1989年說：「我對《魔宮傳奇》一點也不滿意。它太黑暗、太陰森，也太恐怖了。我覺得它比《鬼哭神號》（1982）還嚇人。《魔宮傳奇》裡沒有一絲我個人的感受。」他後來在《魔宮傳奇》製作特輯紀錄片中補充：「《魔宮傳奇》是三部曲中我最不喜歡的一部。回頭看，我會說：『我從中最大的收穫，就是認識了凱特·卡普蕭。我們多年後結婚，對我來說，這就是我命中註定要拍《魔宮傳奇》的原因。』
他第一次與喬治·盧卡斯合作是在《美國風情畫》（1973）。這差點害他失去韓索羅與印第安納瓊斯這兩個代表作角色。盧卡斯原本決定不在《星際大戰四部曲：曙光乍現》（1977）起用任何《美國風情畫》的演員，但後來改變主意，請哈里遜來試讀，只為了讓試演韓索羅的演員人數與試演路克、莉亞的人數相同。他後來成為史蒂芬·史匹柏心目中印第安納瓊斯一角的首選，但盧卡斯起初反對，說自己已經和他合作過2部片，不想讓福特「變成我的勞勃·狄尼洛」，指的是馬丁·史柯西斯在好幾部片中重用狄尼洛。
含劇透的冷知識
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按照系列傳統，主要反派都因自身的狂妄而喪命：他們所尋求的超自然神器會直接或間接地在肉體上影響或毀滅他們。在《法櫃奇兵》（1981）中，勒內·貝洛克、阿諾德·托特少校與赫曼·迪特里希上校往約櫃裡看時，被櫃內的力量毀滅。在《魔宮傳奇》（1984）中，莫拉·拉姆想抓住1顆燃燒的桑卡拉石，卻失足墜落，被下方河裡的鱷魚撕碎吃掉。在《聖戰奇兵》（1989）中，華特·唐納文喝下1只假的聖杯後，在幾秒內衰老化為塵土。在《印第安納瓊斯：水晶骷髏王國》（2008）中，伊琳娜·史帕可上校博士被她渴望的知識所壓倒，那是跨維度生物的水晶骷髏所賦予的，導致她自燃，遺骸被傳送到那些生物的家鄉世界。在本片中，啟動後的安提基特拉機械把尤爾根·佛勒帶到古代，他的飛機被羅馬士兵成功擊落，他也因此喪命。雖然和莫拉·拉姆一樣，神器並未直接奪走佛勒的性命，但它的使用最終導致他死亡。這也使他成為唯一死後遺體大致仍保持完整的主要反派。
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片中其實有2個時段，而非1個，能看到哈里遜·福特以回春或老妝現身。第1個是明顯的1939至1945年二戰段落。第2個是印第安納瓊斯去找巴索·蕭（陶比·瓊斯飾）取回安提基特拉機械的時候。這估計是1951年，因為印第說他已經18年沒見過海倫娜（菲比·沃勒-布里奇飾），而本片背景設定在1969年。因此，這是在《印第安納瓊斯：水晶骷髏王國》（2008）所描繪的事件之前6年，該片背景為1957年。在這段戲裡可以清楚看出，福特比他在片中大部分時候年輕約20歲，但明顯仍比開場段落時年長。
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在艾莎把「正確」的聖杯遞給唐納文那場戲裡，她剛把杯子交到他手上，便極其細微地朝印第安納瓊斯望去並搖了搖頭，暗示她是故意給唐納文錯的杯子。
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根據小說改編版，太陽神杖杖首上的銘文寫有一項明確警告，叮囑不可直視約櫃。正因如此，印第安納與瑪莉安在片尾僅憑閉上雙眼，便得以在大火中倖存。這或許是呼應《撒母耳記上》第1書6:19，上帝因伯示麥人窺視約櫃而「擊殺」了他們。
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這是唯一一部印第安納瓊斯完全沒有使用、甚至沒攜帶左輪手槍的電影。
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印第安納在船上對瑪莉安說的那句「問題不在年歲，親愛的，而在里程」，是哈里遜·福特即興加上的。
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當唐諾文說他的團隊距離聖杯只差一步時，印第安納評論道：「通常那就是腳下地面塌陷的時候。」巧合的是，片尾正好發生了兩次這樣的情況。第一次是印第安納必須通過「上帝之言」的考驗，差點從地板跌落；第二次是聖杯神殿劇烈震動、地板崩塌。
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早期的構想是以一場從神殿與山谷逃脫的精心設計橋段來結束本片。然而史蒂芬·史匹柏後來改變了主意，因為他意識到在前一場戲中，亨利救了印第安納、兩人終於找到畢生追尋之物，電影的情感高潮已然到達。
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劇本初稿曾安排印第安納瓊斯前往上海尋回拉之權杖的一部分。他在逃離收藏該物的博物館時，原本要躲在一面巨大的滾動銅鑼後方以躲避機槍掃射。同一份劇本中，印第安納與瑪莉安還要在約櫃開啟引發的混亂中，展開一場瘋狂的礦車追逐。這些場面後來從劇本中刪去，卻出現在魔宮傳奇（1984）裡。
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當印第安納與艾爾莎在地下墓穴中找到二哥的陵墓時，兩人將其打開，短暫瞥見了十字軍騎士的頭骨。他的面部特徵與他們之後會遇到的第三位兄弟極為相似。
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在設定於1969年的第一場戲中，鏡頭掃過印第安納的公寓。架上放著他兒子的照片，旁邊是一面折疊好的美國國旗，那是發給陣亡退伍軍人家屬的。這是關於他兒子從軍及後來陣亡的第一條線索，之後印第安納在船上向海倫娜提起時獲得證實。
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印第安納首度被看到戴著一枚金色婚戒，顯示他仍與瑪莉安維持婚姻。
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海倫娜曾數次幫印第安納保住他的帽子。在印第安納走出巴索公寓的回憶片段中，他忘了帽子，年幼的海倫娜把它拿出來交給他。到了片尾，印第安納與海倫娜準備跳出飛機時，她又在他跳下前一把從他頭上抓走帽子，而他最後在地面上順利戴回。
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片尾印第安納與瑪莉安重逢時，他親吻她身上幾個部位，正是她在法櫃奇兵（1981）中、印第安納遭納粹所傷後在船上親吻過的地方。
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馬特威廉斯原本設定為某種書呆子型角色，但喬治·盧卡斯決定讓他成為印第安納的兒子，並賦予他叛逆的性格，理由是：「他必須是老亨利瓊斯眼中的兒子，而詛咒以親生兒子的形式回到印第安納身上。他集所有父親無法忍受的特質於一身！」
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本片有多處向聖戰奇兵（1989）致敬，尤其是馬特與印第的關係，在本片中與聖戰奇兵裡印第和父親的關係有許多相似之處。例如印第覺得馬特的名字很有趣，就像印第的父親當年覺得印第捨本名小亨利瓊斯、改用狗名很有趣一樣。另一例是馬特騎機車穿過校園時撞倒紅色布條。當他成功阻止KGB追捕他與印第後，轉頭對印第微笑，印第卻回以一臉不以為然。印第在聖戰奇兵中成功甩掉納粹追兵後，也對父親做了完全相同的舉動，而他父親同樣一臉不以為然。
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在Brunwald城堡的營救過程中，老亨利瓊斯對印第安納無意間讓日記落入敵手感到懊惱，說他「應該把它寄給The Marx Brothers」。Harpo Marx在自傳中透露，他當年真的得把一本載有重要文件的日誌偷偷帶出俄羅斯，以免落入敵人之手。
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印第安納瓊斯在任何一集電影裡都沒有親手殺死主要反派。他們的死，向來都是寶物本身、對寶物的貪念，或寶物的力量所致。
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史蒂芬·史匹柏和喬治·盧卡斯曾為印第安納的同伴該是誰爭論不休。其中一個構想是讓她當納粹間諜。放棄這個想法後，兩人又拿不定主意，究竟要讓這個角色是印第安納的前導師，還是舊情人。最後是Lawrence Kasdan的點子，把兩個構想合而為一，讓她成為印第安納老師的女兒。印第安納與納粹間諜同行的構想，後來在聖戰奇兵（1989）中再度派上用場。
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安提基特拉機械裝置以及時空旅行的情節，都是James Mangold構思出來的。據這位編劇兼導演所言，David Koepp先前的劇本版本裡有個MacGuffin，「只是另一件有力量的古物，跟我們看過的古物差不多」，與印第安納瓊斯毫無情感連結。不過，Mangold原本的結局是讓時空旅人回到1939年，印第安納瓊斯因而陷入兩難，得試圖阻止Jurgen Voller殺害Adolf Hitler。Mangold後來意識到這太容易預料、情感上也無法滿足觀眾，於是改成這是Voller計畫的終極目標，卻因計算失誤把他們帶到西元前3世紀而弄巧成拙，而那個時代對印地別具意義。
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坦克大戰之後，印第安納瓊斯嘴唇流血，頭側還留有坦克履帶的壓痕。等他到了神殿、找到聖杯、喝下聖水，帶著聖杯去見父親時，身上可見的傷勢全都消失了。這展現了聖杯的療癒之力，直到Elsa打破封印為止。另外，騎士最後一個鏡頭出來揮手道別時，他心裡明白自己的不死之身已不會再持續下去。
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太空船啟航後不久，印第安納對Mutt說：「Why don't ya stick around, Junior?」在聖戰奇兵（1989）中，老亨利瓊斯（史恩·康納萊爵士）常以「Junior」稱呼印第安納，令他相當惱火。
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這部片在David Koepp和Jeff Nathanson最後改寫之前，至少寫過3個主要版本。第1版是Jeb Stuart於1993年所寫，他是哈里遜·福特在兩人合作絕命追殺令（1993）時向喬治·盧卡斯推薦的。該版副標題為「Saucerman from Mars」，用了許多後來出現在本片的情節元素，包括Doomtown核爆橋段、發射艙測試打鬥、叢林、俄國敵人，以及印第安納最後與一位名叫Dr. Molly的科學家同行結婚。第2版由傑弗里·鮑姆於1995年寫成，乾脆就叫「Indy IV」，內容是印第安納尋找諾亞方舟。鮑姆的版本含有後來用進最終電影的元素，包括Marion回歸、印第安納有個兒子（名叫Abner，設定為宅男）、外星人，以及主要目標物是水晶骷髏。這版原本可能在電影於1996年上映時採用，但據史蒂芬·史匹柏說，當時因為Independence Day（1996）上映、片中同樣有外星人而遭擱置。第3個主要版本由Frank Darabont所寫，副標題為「City of Gods」，與最終電影非常相似，有Marion，但也加入了Oxley、刪掉了Mutt。據說史蒂芬·史匹柏很愛這份劇本（據Darabont說，他稱之為自法櫃奇兵（1981）以來讀過最棒的劇本），但盧卡斯未說明理由就否決了。Koepp看過本片先前所有版本，保留他認為不錯的點子。他盡量不讓自己的作品變成「粉絲劇本」，避免對前作做任何瑣碎的引用。他指出故事必須正視福特與瓊斯的年紀，也力求重現第1集的喜劇與冒險混搭風格，試圖讓它比第2集不那麼陰暗，卻又比第3集不那麼搞笑。最終劇本採用了3個版本的情節元素。
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哈里遜·福特大約20歲時在南加州一場車禍中割傷了下巴。片中這個傷痕被解釋成少年印第安納瓊斯被鞭子打傷下巴所致。
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在《聖戰奇兵》（1989）中，哈里遜·福特飾演的印第安納被父親當頭砸碎的那款明朝花瓶，同一設計的版本可在紐約場景中看到：印第安納與海倫娜遭沃勒手下圍堵後不久，印第安納推倒的層架上就擺著一只。
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西亞·李畢福在《印第安納瓊斯：水晶骷髏王國》（2008）中飾演印第安納的兒子馬特，片中交代他後來已經過世。故事從頭到尾都沒提過馬特的名字，也沒出現他的容貌，只以「我的／我們的／你的兒子」稱之。共同編劇兼導演詹姆斯·曼高德解釋，片中實在沒有空間安插馬特，而且這個角色在上一集的效果並不理想。他曾考慮讓馬特在鏡頭外存活，但最後認為讓馬特的死成為劇情節點、成為印第安納個人悲劇的來源，角色才發揮了更好的作用。
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艾莎是印第安納瓊斯系列電影中唯一由愛人變成反派的角色，也是唯一在片尾死去的愛人。
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柏林納粹集會那場戲中，印第安納（哈里遜·福特）當面與艾莎（艾莉森·杜迪）對峙並奪回日記；史蒂芬·史匹柏要求所有行納粹舉手禮的臨時演員同時把另一隻手放到背後並交叉手指。
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本片延續印第安納瓊斯系列的傳統：主要反派因自身貪念招致的後果、透過超自然力量而死。雖說《魔宮傳奇》（1984）的反派是墜落後被鱷魚吃掉，但起因正是他貪圖那些石頭，石頭因（據稱）超自然的原因變得通紅灼熱，才害他失足墜落。