Harry Potter：199 則幕後冷知識
選角哈利波特是最大難關；他們看過5000個男孩試鏡，卻沒一個對味。製片兼導演克里斯·哥倫布看過丹尼爾·雷德克里夫在《塊肉餘生記》（1999）的演出，便拿給選角指導看，直說雷德克里夫就是不二人選，表現非常出色。但她說他們請不到他，因為他父母希望他專心學業、不演戲，也不想他承受那麼多關注。於是他們在世界各地面試不同國籍的哈利波特人選，始終沒找到。她對哥倫布很頭疼，因為他鐵了心要雷德克里夫。純屬巧合，本片製片與編劇去劇院，前排正坐著雷德克里夫和他父親，雙方聊了起來，慢慢說服他讓雷德克里夫出演。
他目前最喜歡的哈利波特系列小說是第3集《哈利波特：阿茲卡班的逃犯》。
丹尼爾·雷德克里夫證實本片並非他在哈利波特系列中的最愛，他說：「我的演出只有單一調性，我看得出自己變得自滿，原本想達到的效果根本沒呈現出來。」
他8歲時曾試著讀第1本哈利波特小說，卻沒能讀完。直到被選為電影主角，才終於把整本書讀完。
哈利波特系列電影製片大衛·海曼碰巧出席一齣丹和父親艾倫·雷德克里夫都到場的舞台劇。海曼認出雷德克里夫後，因兩人本就相識，便經介紹認識了他兒子；海曼一見丹尼爾，就覺得他非常適合這個角色。事實上，當晚在劇院，海曼忍不住一直盯著丹看，因為他認為丹是演哈利的不二人選。丹尼爾試鏡後拿下這個如今最為人熟知的角色——哈利波特。
丹尼爾·雷德克里夫演出最後2部哈利波特電影，合計片酬5000萬美元，是他接演《哈利波特：神秘的魔法石》（2001）片酬的50倍。
丹尼爾·雷德克里夫證實這是他最喜歡的哈利波特系列作品。
儘管被妙麗稱為偉大的巫師，哈利整部片卻沒有（刻意）施過任何一個咒語。他在動物園不小心讓玻璃消失，在奧利凡德魔杖店買魔杖時也惹出幾起狀況，但全片他從未成功且刻意地施展任何咒語。
丹尼爾·雷德克里夫是在泡澡時得知自己拿下哈利波特一角。
J.K.羅琳在個人網站透露，曾有人邀請她在意若思鏡那場戲飾演哈利的母親莉莉，但她婉拒了，表示自己不是演員，恐怕會「不知怎地搞砸」，這個角色最後由潔拉汀·薩默維爾出演。
他在2014年受訪時透露，拍攝《哈利波特：混血王子的背叛》（2009）期間開始出現酗酒問題，也坦然承認自己的演出因此受到影響。2010年8月，他意識到自己日常作息已過度依賴酒精，便主動戒酒。
丹尼爾·雷德克里夫證實本片和《哈利波特：鳳凰會的密令》是他最愛的電影。
丹尼爾·雷德克里夫說，他原以為自己不會每部電影都演哈利，因為他相信自己長大後就不適合這角色。然而，他後來演完了全部8部電影。
當克里斯·哥倫布被問到想找什麼樣的孩子演哈利波特時，他播放丹尼爾·雷德克里夫在《塊肉餘生記》（1999）的片段，讓對方看看他心目中的理想人選。
第2與第3部哈利波特電影之間之所以延遲開拍，是因為他父母希望他能先過一陣子正常的校園生活。
他與哈利波特同片演員魯伯特·葛林、艾瑪·華森、邦妮·萊特、湯姆·費頓、馬修·路易斯和蓋瑞·歐德曼交情甚篤。
哈利正準備向車長詢問9又3/4月台在哪裡時，月台上抱著女嬰與車長交談的女士，正是飾演哈利母親莉莉·波特的同一位女演員。
本片中，哈利額頭上的疤痕位置偏離中央。這是應J.K.羅琳要求所做的安排。由於她小說封面的插畫，許多人以為疤痕應該位於額頭正中央。不過，書中從未明確指出疤痕在額頭上的確切位置。
作曲家亞歷山大·戴斯培最喜歡的哈利波特角色是多比。
拍攝哈利波特系列電影期間，丹尼爾·雷德克里夫一共用掉160副眼鏡。
丹尼爾·雷德克里夫最初被選為哈利波特時，電影團隊試圖用隱形眼鏡讓他的眼睛呈現書中描述的綠色，而非天生的藍色。丹試戴後出現疼痛的過敏反應，只好放棄這個念頭。團隊接著考慮在後製階段以數位方式改變他的眼睛顏色，但也知道這過程十分繁瑣。他們把難題告訴J.K.羅琳，所幸她表示哈利不一定要有綠眼睛，只要擁有母親的眼睛即可，讓所有人都鬆了一口氣。
電影團隊為了讓孩子們的外貌更貼近小說描述，費盡心思：讓丹尼爾·雷德克里夫（哈利波特）戴上綠色隱形眼鏡，並讓艾瑪·華森（妙麗·格蘭傑）裝上假暴牙。但雷德克里夫的眼睛對隱形眼鏡反應強烈，華森戴著假牙也無法清楚說話，這些構想只好作罷。
選角演出哈利波特的演員是一大難題，他們看了5000場試鏡，卻沒有一個覺得合適。導演克里斯·哥倫布看過丹尼爾·雷德克里夫在《塊肉餘生記》（1999）中的演出，便把片子拿給本片的選角指導看，說雷德克里夫就是不二人選，而且表現出色。但她表示請不到他，因為他的父母希望他專心學業、不要演戲，也不想他承受那麼多關注。於是他們在世界各地面試了不同國籍的「哈利波特」，仍舊沒找到人。她對哥倫布感到無奈，因為他一心認定雷德克里夫。純屬巧合的是，《神秘的魔法石》的製片與編劇去劇院時，發現雷德克里夫和父親就坐在前排，於是雙方聊了起來，慢慢說服了他讓雷德克里夫出演。
哈利這個角色原本屬意由連恩·艾肯演出，但1天後邀約就被撤回，因為發現他不是英國人（艾肯先前曾與克里斯·哥倫布合作《親親小媽》（1998））。
他最初讀《哈利波特》系列小說時並不喜歡。
截至整個系列電影結束，哈利的閃電疤痕由化妝團隊畫了約5,800次。其中丹尼爾·雷德克里夫本人畫了2,000次，其餘則畫在替身與替演身上。
海格一開始把達力·德思禮誤認成哈利波特，達力因此說自己「不是哈利」。原著並無此情節，這可能是個內部玩笑，因為達力正是由哈利·梅林飾演。
是蓋瑞·歐德曼的超級粉絲，兩人在《哈利波特：阿茲卡班的逃犯》（2004）、《哈利波特：火盃的考驗》（2005）和《哈利波特：鳳凰會的密令》（2007）中合作。
丹尼爾·雷德克里夫（哈利波特）受訪時表示，他初次聽說蓋瑞·歐德曼爵士要飾演天狼星·布萊克時嚇壞了，因為他以為蓋瑞的個性會跟他以往演過的角色差不多。真正見到蓋瑞後他大為震驚，發現對方其實是個非常溫暖的人。
在魔法酒吧破釜酒吧裡，哈利和海格走進店內時，酒保對海格說：「老樣子，我想是吧。」這可能是呼應原著，海格經常喝得醉醺醺。
哈利的貓頭鷹嘿美在本片中從未被叫出名字，儘管由約翰·威廉斯譜寫的主題音樂（其他各集也聽得到）就叫「Hedwig's Theme」。
幾乎所有哈利和／或三人組的戲份都按時間順序拍攝，最明顯的例外是：本片最後三人組搭霍格華茲特快車返家的場景其實是最先拍的，接著才是哈利在9又3/4月台初次見到火車的戲（這是另一場需要實體火車入鏡的戲）。之後，魁地奇比賽是最後才拍的，主因是視覺特效部門花了很久才想出怎麼做。
Caio César是巴西知名配音員，曾為丹尼爾·雷德克里夫飾演的哈利波特及其他電影配音，他同時也是軍警，2015年在里約熱內盧阿萊芒貧民窟頸部中彈身亡，得年27歲。
製片兼導演克里斯·哥倫布自看過丹尼爾·雷德克里夫在《塊肉餘生記》（1999）的演出後，就想找他演主角，時間早於公開選角，但蘇西·菲吉斯告訴他，雷德克里夫保護欲強的雙親不會讓兒子接演。哥倫布解釋，正是他堅持要雷德克里夫演出，才導致菲吉斯辭職。2000年，大衛·海曼與史蒂夫·克羅夫斯在倫敦一齣《Stones in His Pockets》的演出中與雷德克里夫及其父母碰面，隨後邀他試鏡。海曼與哥倫布成功說服雷德克里夫的父母，保證兒子不會受媒體侵擾，兩老才點頭讓他演哈利。
丹尼爾·雷德克里夫說過，《哈利波特：消失的密室》是他最喜歡的一集。
語言學專家法蘭西斯·諾蘭博士為本片及其他有爬說嘴的哈利波特電影設計了爬說語。
為了認識3位主角，導演艾方索·柯朗要他們各自以第一人稱寫一篇關於自己角色的文章。艾瑪·華森果然很有妙麗的樣子，寫得有點過頭，交了16頁的長文。丹尼爾·雷德克里夫則像哈利，只寫了簡單的1頁摘要；而魯伯特·葛林特就像榮恩，根本沒交。
雖然哈利在本片沒施展任何咒語，卻做了好幾件魔法的事（例如跟蛇說話），而且全是無意間發生的。這是刻意安排，用來顯示他天生是巫師卻未受訓練，因此必須進入霍格華茲就讀。從第2集到第8集，哈利在17歲生日前都被禁止在校外使用魔法，違者將被開除。
與大衛·霍姆斯是摯友，霍姆斯在前6集哈利波特電影中擔任他的替身。
含劇透的冷知識
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本片事件發生在1992年中至1993年中。哈利被送去的那個場景則發生在1943年。
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（約56分鐘處）哈利（丹尼爾·雷德克里夫）與金妮（邦妮·萊特）在《死神的聖物》上下兩集各吻1次，上集是在婚禮前的廚房，本片則是在大戰期間的樓梯上。
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（約1小時40分鐘處）曾有報導誤稱本片會收錄幾幕丹尼爾·雷德克里夫的裸戲，引發影迷揣測本片會因此被列為更嚴格的級別。結果並非如此。雖然哈利與妙麗接吻的幻象試圖嚇阻榮恩的那場戲，讓人以為雷德克里夫和艾瑪·華森都全裸，實際上兩人都穿著牛仔褲，華森還獲提供無肩帶胸罩，不必完全上空。導演大衛·葉慈表示，全裸並無必要，因為角色會被霧氣部分遮蔽。
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雖然劇情揭露是巴堤柯羅奇二世假扮穆迪，把哈利的名字丟進火盃，但電影從未明確交代他究竟如何騙過火盃選中哈利——畢竟西追才是霍格華茲的鬥士，而火盃每所學校只能提名1位候選人；最接近解釋的說法，是那句「只有異常強大的迷糊咒才騙得過[火盃]」。小說同樣沒有清楚解答，卻留下1條有力線索：穆迪／柯羅奇二世自己推測，有人可能對火盃施咒，讓哈利以第4所學校唯一參賽者的身分入選，使他穩獲資格，好讓他在鬥法大賽的某項任務中喪命。
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開場時，哈利拿給威農1份表格，說是學校要的。後來麥教授召集學生前往活米村，卻不讓哈利同行，因為他的同意書沒有父母或監護人簽名，可見哈利拿給威農的正是去活米村的同意書。電影裡雖未明說，但原著結尾天狼星以合法教父身分替哈利簽了同意書，霍格華茲的教師們欣然接受（因為他們知道天狼星是清白的），這也解釋了為何之後幾集哈利能順利進入活米村。
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在整個系列電影中，高爾是唯一1個施展索命咒的霍格華茲學生。他在萬應室裡試圖用索命咒殺死妙麗。至於哈利在哈利波特：死神的聖物Ⅰ（2010）中為摧毀小金匣而使用該咒時，早已不再就讀霍格華茲。
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瑪姬姑姑出言侮辱哈利的父母時，她數落詹姆，佩妮還客氣地陪笑；但一講到莉莉，佩妮就收起了笑容。無論心中有多少怨懟，佩妮終究思念妹妹，多年後她在哈利波特：死神的聖物Ⅰ（2010）中對哈利直言：「那晚在高錐克洞，你不只失去了母親，你知道嗎，我也失去了1個妹妹。」
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幕後照片顯示，附在奎若教授後腦勺上的佛地魔化身原本有另一款設計。那個版本更具獸性，最明顯的是像黑豹般的口鼻，以及長滿大門牙的寬大下顎。後來設計做了修改：由伊恩哈特配音並以動態捕捉演出佛地魔的臉，之後再以電腦特效加上去。哈利父母遇害的回憶片段中，佛地魔則由李察布雷默飾演。
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鐘與時間是這部片的重要母題。除了霍格華茲那座大鐘樓，片中還有其他鐘在關鍵時刻響起，例如德思禮家的咕咕鐘在哈利把瑪姬姑姑吹脹時報時，活米村酒館裡的落地大鐘則在哈利得知天狼星布萊克是他的教父時正好敲響。
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開場段落中，哈利正在練習咒語。依據巫師法律，17歲以下的人不得在霍格華茲以外施展魔法。這條法律在另外2部哈利波特電影與小說中都是重要劇情：Chamber of Secrets裡，多比在德思禮家施法後，哈利收到警告；Order of the Phoenix裡，哈利施展護法咒後被傳喚出席紀律聽證會。
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魔法部大戰開打不久，哈利解除魯休思馬份的武裝時，天狼星說：「漂亮，詹姆。」這句話與石內卜記憶中詹姆把他倒吊起來羞辱他時，天狼星對詹姆說的如出一轍。
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劇組為哈利與榮恩試圖摧毀史萊哲林小金匣的那場戲，共製作了40個版本的小金匣。
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（約2小時10分處）多比（陶比瓊斯飾）的遺言是「哈利波特」，而這也正是我們在哈利波特：消失的密室（2002）初次見到他時，他開口說的第一句話。
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（約1小時5分處）大約在1小時5分，石內卜、洛哈、哈利與跩哥在決鬥社示範時所行的禮，是修改自擊劍行禮的動作。
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片中哈利親眼看著奎若死去，原著裡奎若死時他則昏迷不醒。這與哈利波特：鳳凰會的密令（2007）產生劇情矛盾：該片中哈利能看見以骷髏馬為形的騎士墜鬼馬，但按原著設定，哈利要等到哈利波特：火盃的考驗（2005）目睹西追迪哥里死去後才看得見牠們。不過實情是，當時《鳳凰會的密令》小說尚未出版，劇組根本無從得知此事——該小說於2003年問世，比本片最初上映晚了2年。
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服裝設計師珍妮泰敏想為3位主角各自的造型建立色彩系統，進一步凸顯角色性格。哈利的服裝以灰、白、黑等中性色為主，因為她認為哈利對自己不太自在，因此不會穿亮色。榮恩的服裝採棕、橙、紅等暖色調，反映他母親從前為他織毛衣，這風格仍留在他身上。妙麗的藍、粉紅與米色系，則用來平衡哈利與榮恩的色彩，同時展現她女性化的一面。
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布萊克家族是巫師界數一數二的大家族。雖說這個家族「男系已絕」，意即基本上已無人承襲這個姓氏，但本片仍有許多角色與該家族有淵源。天狼星·布萊克（蓋瑞·歐德曼爵士）在一場戲中回歸。他的兩位表親分別是貝拉·布萊克·雷斯壯（海倫娜·寶漢·卡特）和她的妹妹水仙·布萊克·馬份（海倫·馬剋剋羅莉），因此跩哥·馬份（湯姆·費頓）也算沾上這層關係。小仙女·東施（娜塔莉亞·特納）是美黛·布萊克的女儿。卡莉朵拉·布萊克嫁給了奈威·隆巴頓（馬修·路易斯）的祖父哈方·隆巴頓。多瑞亞·布萊克嫁給查爾斯·波特，讓詹姆（阿德里安·羅林斯）與哈利（丹尼爾·雷德克里夫）也成了這個家族的一員。諷刺的是，塞德蕾拉·布萊克嫁給了塞普提默斯·衛斯理，讓彼此水火不容的衛斯理與布萊克兩家也結為親家。
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（約1小時28分處）約在1小時28分，哈利透過在日記上寫字與湯姆·瑞斗溝通時，畫面上出現的筆跡並非丹尼爾·雷德克里夫本人的。克里斯·哥倫布認為雷德克里夫的字跡不像哈利會寫出來的樣子，於是改用了1名臨演的筆跡。
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哈利、榮恩和妙麗正在討論如何利用變身水冒充克拉和高爾（如此一來便能從跩哥口中套出情報）。他們這麼做是為了查明跩哥是否就是史萊哲林的傳人。之後，妙麗到圖書館拿了一本名為「Most Potente Potions」的書。她伸手去拿的那本書右側，還有另一本書，書脊上只寫著「TOM」這個字。佛地魔成為黑魔王之後，視湯姆·瑞斗為自己次要、較低階的身分。
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孩子們為了耶誕舞會的華爾滋，大約練了3週的舞。然而丹尼爾·雷德克里夫幾乎出現在整部片的每一場戲裡，因此只有4天時間準備這項任務。他在多次訪談中都以此解釋，為何他的舞姿大多只拍到腰部以上（以免露出他笨拙的腳步）。所幸這不算大問題，畢竟哈利本來就不該是個舞藝精湛的人。
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（約27分處）約在27分鐘時，雖然佛地魔並未在本片現身，但當哈利和朋友們走上樓梯、發現胖女士正在唱歌時，畫面右下角可以看到一幅會動的佛地魔畫像。
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（約1小時2分處）在本片中，雷文克勞的王冠嚴格說來是唯一由2個人聯手摧毀的分靈體：哈利先以蛇妖的毒牙刺穿它，榮恩隨後再把它踢進高爾施法燃起的火焰裡。
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（約57分處）約在57分鐘時，哈利走進萬應室，畫面左下角出現了榮恩在哈利波特：神秘的魔法石（2001）中騎乘的那名騎士。此外，還有吉德羅·洛哈在哈利波特：消失的密室（2002）裡放出來的康瓦耳小精靈。整個場景完全由歷來各集的道具搭建而成，共約72箱道具。
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每當哈利和張秋在一起、與她調情時，金妮都顯得醋意十足。這為兩人在哈利波特：混血王子的背叛（2009）中成為情侶埋下伏筆。
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佛地魔以分靈體的身分殺死哈利之後，哈利便失去了說爬說語的能力。
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這是哈利和榮恩第2次被罰留校察看，也是第2部出現此情節的電影。在哈利波特：鳳凰會的密令（2007）中，哈利又因說「謊」和教導「鄧不利多的軍隊」而被恩不里居罰了2次留校察看。榮恩和妙麗則在該片中分別第3次和第2次被罰留校察看，原因是他們參與了「鄧不利多的軍隊」。
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這是唯一一部哈利沒有施展任何攻擊咒語的哈利波特電影。
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原著中，哈利、妙麗、奈威和跩哥因被罰留校察看，與海格在禁忌森林度過了一夜；但在電影裡，奈威被換成了榮恩。這是因為原著中有一段未被採用的情節：榮恩被巨龍挪威脊背龍咬傷，必須進醫院廂房，奈威便代他受罰，因為他和哈利、妙麗一樣在宵禁後被抓到在外遊蕩，諷刺的是，他其實是想警告他們跩哥正打算設陷阱害他們。
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哈利從湯姆的日記學到、並用來對付來襲蜘蛛的「Arania Exumai」咒語，原著中並沒有。
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在哈利於多比墓碑旁登場的開場戲中，他望著玻璃碎片裡的倒影時，倒影裡短暫閃現了阿波佛·鄧不利多（希朗·漢德）的身影。後來揭曉，那其實是阿波佛鏡子的一片碎片，而倒影正是他在暗中看顧哈利一行人。
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雖然哈利最後倖存，但這是唯一一部他沒有說出最後一句台詞的哈利波特電影（改由他的兒子阿不思·賽佛勒斯·波特來說）。值得一提的是，原著結尾時，最後一句對白仍由哈利說出，其餘文字則屬敘述。
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在故事高潮，哈利聲稱劫盜地圖在說謊，因為地圖上顯示了已死的彼得·佩迪魯。然而天狼星回應道：「地圖從不說謊！」，顯示他早知這張地圖的存在。片中強烈暗示路平先前也認出了這張地圖，只是電影始終沒有完整交代原因。此外，劫盜地圖署名為「月影、獸足、鹿角、蟲尾先生」，但除了蟲尾（彼得·佩迪魯）之外，前3人的身分始終沒有交代清楚。這點令人意外，因為這在原著中是重要的背景資訊：4名劫盜分別是路平和他的3位好友詹姆·波特、天狼星·布萊克與彼得·佩迪魯。路平是狼人（故稱「月影」），另外3人於是學會成為化獸師，能變形成動物，以便體諒路平，並在他變身期間陪伴在側（因為狼人只對人類有危險，對其他動物則無）。詹姆是雄鹿「鹿角」（這項特質也遺傳給了他兒子哈利的護法），天狼星·布萊克是黑狗「獸足」，彼得·佩迪魯則更明顯是老鼠「蟲尾」。他們4人還共同製作了劫盜地圖，好讓自己能神不知鬼不覺地探索霍格華茲的城堡與校園。
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電影開場時，哈利正在翻看《哈利波特：神秘的魔法石》（2001）片尾海格送給他的相簿。他第一眼看到的照片，是父母詹姆與莉莉抱著嬰兒時期的哈利。所有回歸客串的演員都沒有列名。
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（約1小時16分處）大約在1小時16分，海格衝進鄧不利多的辦公室為哈利辯護時，手裡拎著一隻死公雞。這是呼應書中（電影刪去）海格發現所有公雞都死光的一幕。公雞的啼叫聲對蛇妖而言是致命的。
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（約1小時29分處）大約在1小時29分，湯姆·瑞斗把哈利吸進日記、帶他回到50年前時，日期是6月13日。這個安排相當巧妙：從哈利2年級發生此事的時間點往回推50年，6月13日恰好是星期五。
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丹尼爾·雷德克里夫自己想出一個點子：為了向哈利最敬重的老師致意，他穿上一種類似路平教授（大衛·休利斯）在《阿茲卡班的逃犯》授課時所穿服裝的打扮。導演大衛·葉慈很喜歡這個建議，於是那些場面中他的造型便以此為基礎。
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就跟他的角色一樣，魯伯特·葛林特患有嚴重的蜘蛛恐懼症，至今仍不敢看完榮恩和哈利身處阿辣哥巢穴的那整場戲。那場戲裡榮恩驚恐的表情與坐立難安，並非演技，而是葛林特光是想到蜘蛛就有的真實反應。
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哈利隨身攜帶的那塊鏡片，不該是阿波佛那面鏡子的一部分，因為阿波佛是向蒙當葛買下天狼星那面（理應完整的）鏡子。哈利的鏡片其實是他自己那面摔碎後剩下的碎片，原本那對鏡子中的另一半。
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哈利在鏡中看見父母的這場戲，原本（依原著）應該讓他看見全家人。不過，當鄧不利多撞見哈利獨自對著鏡子時，從鏡框背面的畫面暗示他看見的是全家人。書中哈利也問鄧不利多從鏡中看見什麼，鄧不利多回答他看見自己拿著一雙襪子，說這是他很想收到的禮物，總比平常收到的那些書好。哈利後來覺得鄧不利多可能是在開玩笑。
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（約2小時25分處）大約在2小時25分，哈利露出自己少了一隻襪子的那場戲，要求丹尼爾·雷德克里夫先刮腿毛。
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許多哈利波特迷認為多比的死是整個系列最令人心碎的場面。
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書中哈利身處迷宮時會遇到人面獅身獸，還得解開牠的謎題，但電影裡並沒有出現人面獅身獸。
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（約1小時40分處）大約在1小時40分，金妮和哈利走進萬應室時，身後可以看到一面眼熟的鏡子。它的外形與第1集電影及原著中的意若思鏡相同。
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佛地魔與其追隨者極度看重血統純正。諷刺的是，佛地魔自己就是混血，母親是女巫、父親是麻瓜。這點在書中著墨更多：哈利聽到的預言長得多，其中提到「有能力擊敗黑魔王的人將誕生於曾3次反抗他的人家，生於第7個月結束之時」。鄧不利多後來解釋，這段描述也可能套用在奈威·隆巴頓身上，因為他同樣在7月出生，父母也曾3度反抗佛地魔。不過佛地魔大概更屬意哈利，因為哈利也是混血巫師（純血父親、麻瓜出身母親），而奈威是純血；佛地魔鎖定哈利，反而諷刺地「將他標記為與自己對等的人」（留下疤痕），並賦予他擊敗自己的力量，親手造就了他想消滅的那個存在。
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許多粉絲對哈利被安排在火車站這一幕表達不滿，認為他待在德思禮家為天狼星哀悼會更合理，就像書中那樣：鄧不利多隨後登門拜訪，說明哈利繼承了天狼星在古里某街的舊宅，並召喚家庭小精靈怪角來確認，怪角如今聽命於哈利，也就證實了他主人的身分。鄧不利多還解釋，哈利17歲生日後就會永久離開德思禮家，屆時他成年，母親的保護咒也會失效。火車站這場戲其實是向原著致意，因為哈利說過自己喜歡搭火車，那能「幫他把心事拋到腦後」。
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本片結尾天狼星騎著海格的鷹馬逃走，其實是倒轉《哈利波特：神秘的魔法石》（2001）的開場：海格騎著飛天機車抵達，而書中揭露那輛機車是向天狼星借的。
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（約2小時處）哈利（丹尼爾·雷德克里夫）在洞穴裡逼鄧不利多（麥可·坎邦爵士）喝下詛咒之水時，可以聽見鄧不利多說「是我的錯！全都是我的錯！」完結篇《死神的聖物》揭露，鄧不利多的妹妹是在他、弟弟與摯友決鬥時被流彈擊中而死；這道心理創傷讓他始終自責。
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哈利撿起石頭後，佛地魔的靈魂攻擊他。佛地魔之所以沒死是因為分靈體，但J.K.羅琳直到《哈利波特：混血王子的背叛》才揭曉這件事。
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本片揭露石內卜長久以來一直愛著哈利的母親莉莉。這兩位演員早年在《Close My Eyes》（1991）中也有過另一段奇特的感情安排。
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書中第1項任務只是哈利繞圈飛行，讓角尾龍暈頭轉向，好拿到金蛋。本片則把任務拉長：巨龍掙脫束縛，一路追著哈利飛向霍格華茲，哈利差點命喪龍口。不過哈利讓巨龍撞上一座橋，角尾龍墜落，想必就此喪命。此外，與原著不同，片中沒有龍蛋，暗示巨龍只是單純想阻止參賽者越過牠們去取金蛋。
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（約14分鐘處）哈利、榮恩和妙麗談到鄧不利多年紀時，榮恩說「大概150歲，加減幾歲吧」，眾人隨即笑成一團，彷彿那是個玩笑。而這也正好是J.K.羅琳在某次訪談中給出的數字。她後來在官網正式說明，鄧不利多過世時是115歲。
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（約20分鐘處）斜角巷裡那隻替栗子加熱的小龍，其實是匈牙利角尾龍的迷你版；哈利曾在《哈利波特：火盃的考驗》（2005）的三巫鬥法大賽第1項任務中對上這種龍。
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哈利與佛地魔在禁忌森林相遇時，正如書中所述，哈利必須任由佛地魔殺死自己，才能一併消滅那個「佛地魔從未打算製造的分靈體」。原著文字寫得很清楚，基於同樣理由，哈利絕不能出手自衛，魔杖也得收在分靈體搆不到的口袋裡。但在電影這場戲中，哈利把魔杖握在右手，這個劇情關鍵點因此形同失效。
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本片更陰暗、更冷峻的調性，其實在主標題就已透露端倪：華納兄弟標誌出現時，「海德薇主題曲」先是層層堆疊至高潮，接著哈利波特標誌揭曉，樂曲轉為全新、更為沉靜的編曲，相較《哈利波特：神秘的魔法石》（2001）既有的版本顯得格外不祥而陰森。「消失的密室」副標題則在低音弦樂進場的那一刻浮現。
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（約1小時16分鐘處）大約1小時16分時，衛斯理先生（馬克·威廉斯）那間堆放麻瓜物品的棚屋裡，除了其他雜物，還擺著2台Remington Noiseless Portable打字機和1台HP LaserJet 4。有趣的是，哈利的姓名縮寫正好是「H.P.」。
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（約16分鐘處）大約16分鐘時，也就是本片開頭不久，哈利看到1篇附有衛斯理一家在埃及照片的報紙報導。這件事之後雖未再被提起，在原著中卻是極為重要的劇情關鍵：魔法部長康尼留斯·夫子視察阿茲卡班時，手邊正好有1份那樣的報紙，便把它交給想玩填字遊戲的天狼星·布萊克。天狼星一眼就認出化名斑斑的彼得·佩迪魯／蟲尾，驚覺這個背叛他的朋友還活著，於是決心向他復仇。由於催狂魔不知道天狼星是化獸師，也感應不到動物的思緒，天狼星便變身成狗逃脫。
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原著系列中，哈利波特被形容為一頭又長又亂的頭髮。丹尼爾·雷德克里夫在本片的造型，堪稱全系列最貼近書中哈利，因為他的頭髮是整個系列裡最長也最亂的，這或許也解釋了海格為何對他說「也許可以試著［梳梳頭］」。
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為了拍出哈利和榮恩撞上渾拚柳的那場戲，共報廢了14輛福特Anglia。
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電影裡從沒見到妙麗騎掃帚飛行，但在原著中，她和哈利、榮恩一起騎掃帚去追捕1把飛天鑰匙。
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片尾西追死後，就沒人再提起三巫鬥法大賽。原著中，哈利與西追並列第1，但西追身亡後，哈利被宣告為實質贏家。他獲得1大筆獎金，卻因西追之死而深感愧疚，便想把錢交給西追的父母，對方婉拒了。他轉而把錢送給衛斯理雙胞胎，幫他們實現開玩笑商店的夢想。
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（約1小時21分鐘處）妙麗與哈利共舞的著名橋段，是專為本片而寫，出自編劇史蒂夫·克羅夫的原創構想，原著小說中並沒有。這場戲是製片大衛·海曼在整個系列中最愛的片段之一，而選用的舞曲是Nick Cave and the Bad Seeds演唱的「O Children」。
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（約2小時25分鐘處）大約2小時25分時，魯休斯·馬份在片尾試圖詛咒哈利，口中喃喃念著「阿哇呾……」。如第4集所述，這是不赦咒「阿哇呾喀呾啦」，也就是索命咒的起頭。這不免讓人覺得馬份蠢到竟想在一所滿是學生和教師的學校中央殺害1個孩子，而且毫無脫身之法。不過正如傑森·艾塞克在多次訪談中解釋的，小說並未指明他該用哪個咒語，而他當時剛好在讀第4集，這是他唯一記得的咒語。所以說到底，這場戲裡是多比救了哈利一命。
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2009年12月12日，本片為藍光版持有者舉辦了1場特別的「BD-Live」放映活動，堪稱首創。觀眾可一邊觀賞藍光版電影，一邊即時聆聽丹尼爾·雷德克里夫與大衛·巴倫（代因病缺席的大衛·葉慈上陣）的現場解說，2人一邊看片一邊主持活動。他們在放映過程中暢談整個系列的方方面面，還回答了觀眾提出的若干問題。這場放映會上，他們針對本片透露的幕後花絮少得可憐，其中包括：片中學生喝的「奶油啤酒」，其實是英國知名果汁飲料「J2O」，只是在上頭加了假奶泡。不過，為預定興建的哈利波特主題樂園打造的正宗「奶油啤酒」正在研發中。某場戲裡榮恩嘴邊的泡沫是用蛋白做的。丹尼爾坦言，他從不嘗試在這種戲裡擠出「真眼淚」，這是肯尼斯·布萊納給他的建議；他改以演技和「業界訣竅」來達到想要的效果。鄧不利多儲思盆裡那奇怪的「液體」完全是以電腦特效製成。洞穴中鄧不利多喝下、極其折磨人的那種液體，其實只是加水稀釋的牛奶，再經電腦特效部門在畫面上「微調」。巴倫提到，大衛·葉慈和作曲家花了「好幾個月」想做出1段特定的「鳳凰之歌」配樂，認為這樣才對得起書中的描述，用於鳳凰飛離霍格華茲的那場戲。他們譜寫並試過好幾種不同版本，最後幾乎是放棄了，才定案為我們現在在片尾聽到的這段極為簡單的配樂。
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鄧不利多憤怒質問哈利是否把名字放進火盃的那場戲，不僅被粉絲狠批不符合鄧不利多的性格，還衍生出許多迷因。這些迷因大多聚焦於這場戲在書中與片中的差異；書裡明確描述鄧不利多是「平靜地」提出這個問題。
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多比下葬後，哈利獨自留在墓地，在墳上放了一顆小石頭。猶太人有個古老的習俗，是在墓地上放小石子或鵝卵石，以示追思與敬意（哈利波特並非猶太人角色，但飾演他的丹尼爾·雷德克里夫自認是猶太人）。本片拍完後，這場戲的拍攝地點（威爾斯彭布羅克郡的淡水西海灘）成了哈利波特迷的朝聖地，訪客留下數百顆小石子向多比致敬。然而2019年底，國民信託決定移除這座紀念地和悼念石子，因為湧入的訪客對海灘造成負面環境影響。對海洋生態尤其有害的是被留在海灘上的數千隻襪子；襪子一旦被海龜、海豹等海洋動物誤食，很容易令牠們喪命。
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（約1小時50分處）在倒數第二場戲中，可以看到哈利摧毀接骨木魔杖，並把它扔下橋。但在書裡，他用它修好自己的魔杖（他說有了它就很滿足），因為接骨木魔杖是唯一能修復斷裂魔杖的魔杖。之後他把接骨木魔杖放回鄧不利多的墳墓，並希望自己死於自然原因。如此一來，魔杖就沒有合法的主人，也會因此失去力量。
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搭乘騎士公車時，那顆縮小的頭顱警告哈利：「如果你點了豌豆湯，記得要在它吃掉你之前先吃掉它。」後來他與夫子交談時，夫子請哈利喝豌豆湯，哈利堅決拒絕。
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在片尾，哈利要多多比承諾絕不再試圖救他的命。多比微笑，但沒有口頭答應。在《哈利波特：死神的聖物Ⅰ》中，多比為了救哈利而喪命，被貝拉的刀刺中。
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哈利拿著劫盜地圖在霍格華茲遊走時，從地圖上移動的鞋印看出彼得·佩迪魯正走近，卻始終沒見到他。後來解釋說，佩迪魯是以斑斑——榮恩·衛斯理的寵物鼠——的實體形態匆匆走過，他以那個形態度過了十幾個年頭。這（可說）意味著他在地圖上以動物足印呈現會比人類鞋印更準確。然而在書和電影中，都顯示地圖能看穿大多數魔法隱藏；在《火盃的考驗》小說裡，地圖準確顯示出以變身水易容者的真實身分。另外要注意，片中的地圖不顯示動物，只顯示人類，儘管片尾字幕時有個搞笑橋段，以各自的足印顯示幾隻動物在霍格華茲四周的移動。
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原本的拍攝劇本是寫成哈利在鄧不利多被殺後取得他的魔杖。開拍前不久，系列最後一本書出版，書中鄧不利多的魔杖以及誰擁有它成了重大關鍵，因此劇本不得不修改。
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這是唯一一部鄧不利多完全沒有以任何形式說出哈利波特名字的電影（哈利、波特先生、哈利波特先生、哈利波特，就是沒有波特）。不過在大家都在大廳睡覺的那場戲裡，石內卜問鄧不利多是否該警告哈利時，鄧不利多以「他」來指哈利。
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丹尼爾·雷德克里夫無法忍受隱形眼鏡，所以哈利被附身的那場戲，他的眼睛是以數位方式修改的。
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麥教授教葛來分多男女生跳舞時，可以看到金妮·衛斯理坐在前排，與妙麗隔了幾個座位。在書裡，舞會只開放給4年級以上的學生，但3年級的金妮能去，是因為4年級的奈威·隆巴頓邀請了她。麥教授原本的劇本是先告訴哈利，按傳統由鬥士開舞來宣布耶誕舞會。當哈利難以置信地問「跟女生嗎？」，麥教授回答說他願意也可以帶奈威去。這場戲後來改成麥教授在最後一刻才告訴哈利，他必須為舞會開舞。
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佛地魔在墓地復活時，是用左手與哈利波特決鬥。這是整個系列中他唯一一次這麼做。
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尖叫屋內部殘破不堪、滿是被破壞的痕跡，不過電影從未明確解釋原因，也沒說明天狼星與路平為何知道要從渾拚柳底部的隧道進入。書中解釋，鄧不利多教授允許年幼的路平就讀霍格華茲，條件是他每個月在變身為狼人期間，都得把自己隔離在這棟特意建造的屋裡，以免傷及他人。渾拚柳被種在隧道入口上方，防止其他學生闖入，而路平每個月的嚎叫與在屋內橫衝直撞的聲響，很快就讓這棟屋子蒙上鬧鬼的傳聞。事實上，鄧不利多還刻意助長這些傳言，好讓大家不敢靠近。路平的朋友詹姆、天狼星與彼得得知他的秘密後，紛紛成為化獸師，以便每個月進屋陪伴他，因為狼人對動物並不構成威脅。書中哈利也得知石內卜為何如此痛恨詹姆與天狼星：石內卜發現路平每個月都會進入這棟屋子後，天狼星開玩笑地慫恿石內卜跟蹤路平一探究竟。詹姆意識到這可能害死石內卜，千鈞一髮之際才把他從狼人形態的路平爪下救出。石內卜始終對天狼星與詹姆懷恨在心，認為他們曾想引他送死，後來改變主意並非擔心他的安危，而是怕被學校開除。
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哈利（丹尼爾·雷德克里夫飾）看到主桌旁的石內卜（艾倫·瑞克曼飾）時疤痕作痛，其實當時奎若教授（伊恩·哈特飾）後腦勺上、佛地魔（理查·布雷默飾）藏身的那張臉正對著他。哈利把疼痛歸咎於石內卜在場，殊不知佛地魔一直盯著他看。另外，不妨留意石內卜看到哈利疤痕疼痛時的反應：他望向奎若，顯然對他起了疑心。
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有個熱門的粉絲理論推測，重生石其實並非真的讓亡魂重返人間，而是製造出那人的幻影，好讓使用者相信自己非死不可。在《死神聖物》的故事裡，二哥召喚出死去的摯愛，其身影令他憂鬱到自我了斷，讓死神得以帶走他。在本片中，哈利藉由石頭看見死去摯愛的臉孔，而他們竟全然不像平日的自己，一致說服他必須赴死。
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（約2小時25分處）約2小時25分處，劇本原本寫的是妙麗在最後一場戲裡擁抱哈利與榮恩。當年11歲的艾瑪·華森對於要在全體演員面前抱兩個男生感到難為情，克里斯·哥倫布便允許她改戲，讓妙麗只抱哈利，接著正要抱榮恩時，兩人尷尬起來，最後只握了握手。華森在近期受訪時也提到，她老是太快放開丹尼爾·雷德克里夫，所以電影畫面被「定格」了幾秒，讓這個擁抱看起來比實際更久。粉絲也把她對榮恩的猶豫解讀為兩人日後戀情的伏筆。
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當哈利在霍格華茲中庭現身、表明自己還活著時，馬份原本會率先脫離食死人行列，並把自己的魔杖扔給哈利。這場戲拍了，卻沒剪進最終版本，不過在以本片為基礎改編的遊戲裡可以找到。
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約翰·威廉斯的配樂在結尾留下一個提醒，暗示哈利日後將面臨的危險之一。整部片中，威廉斯以大鍵琴動機來表示彼得·佩迪魯的出現。哈利在片尾字幕結束時說完「Nox」後，短暫停頓，大鍵琴動機又再度響起，暗示佩迪魯在下一集將扮演重要角色。
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（約56分鐘處）約56分鐘處，哈利、榮恩與妙麗在鄧不利多軍隊名冊上的簽名，與美國版書籍中出現的簽名一模一樣。
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在尾聲場景飾演哈利女兒莉莉的小女孩達芙妮·德貝斯特吉，非常黏丹尼爾·雷德克里夫，甚至沒在拍攝時也會抱著他。雷德克里夫受訪時表示，她似乎把他當成第二個爸爸，但他完全不介意被她抱，還說覺得她真的很可愛。他也提到，達芙妮的母親懷著她時，正在參與《哈利波特：神秘的魔法石》（2001）的製作。
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（約1小時處）衛斯理雙胞胎把劫盜地圖交給哈利時，上頭的「Moony」被拼錯成「Mooney」。這其實不算錯誤，背後還有一段有趣的關聯：本片的視覺特效總監名叫卡爾·穆尼（Karl Mooney）。這個拼法是刻意改的，算是個內部玩笑。
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穆迪向哈利解釋仇敵鏡能幫他監視敵人時，小巴堤·柯羅奇父親的臉一閃而過。穆迪還告訴卡卡洛夫，自己以前「思考方式跟黑巫師一樣」。這兩幕都預示了穆迪其實是巴堤·柯羅奇二世假扮的。
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艾倫·瑞克曼於2016年1月14日辭世後，「Always」這個詞（石內卜在記憶中說出、由哈利波特目睹）在全球瘋傳，以悼念這位已故演員。
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鄧不利多的一句台詞「別跟他打，哈利，你贏不了的。」幾乎出現在每一支預告片和電視廣告中，然而最終版本裡完全找不到，DVD收錄的加長片段也沒有。
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片尾載著新一代孩子的火車駛離王十字車站、開往霍格華茲時，這場戲配的樂曲與《哈利波特：神秘的魔法石》（2001）最後一幕相同，當時哈利向海格道別，搭火車離開霍格華茲返家。這首曲子名為「Leaving Hogwarts」，除了「海德薇主題」之外，可說為整個系列正式畫下句點。
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（約33分鐘處）哈利進入萬應室，那名男孩透過廣播通知鳳凰會他已現身時，你可以看到桌上擺著奈威的魔蘋果：那株植物正是他在《哈利波特：鳳凰會的密令》（2007）開頭坐在馬車上時捧著的。
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這部片刪掉多比之後，奈威·隆巴頓的戲份反而稍微加重。片中把鰓囊草交給哈利去應付第二項任務的人變成奈威，而非多比，後來我們還得知這主意其實是小巴堤·柯羅奇／穆迪教授給他的。原著裡，柯羅奇／穆迪解釋他最初的做法是把提到鰓囊草的書交給奈威，但哈利因為規定不能求助，所以沒去問奈威，只告訴榮恩和妙麗他該做什麼。於是穆迪安排多比偷聽到他談論此事，在任務開始前把鰓囊草交給哈利。這一改動也帶來一個頗不尋常的副作用：理應對石內卜教授怕得要命的奈威，這下得從石內卜的儲藏室偷走鰓囊草。
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（約1小時15分處）哈利在地圖上看到彼得·佩迪魯的名字，卻沒在走廊上真正見到他時，可以隱約聽見老鼠竄跑的聲音。
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最後一集小說出版前，丹尼爾·雷德克里夫曾問J.K.羅琳哈利最後會不會死。羅琳頓了一下，語帶玄機地回答：「你會有一場死亡戲。」
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導演大衛·葉慈表示，他原本拍出的版本長達3小時，但因為片長多出45分鐘，最終剪輯時不得不刪掉一些素材，因此好幾個曾用來拍攝不同場景的地點都沒出現在最終版本裡。在Virginia Water拍攝的場景中，麥姬·史密斯飾演的麥教授從昏擊咒中恢復過來，她是在魔法部前來逮捕羅彼·考特拉尼飾演的海格時與對方激烈衝突而中咒。Burnham Beeches則用來拍攝海格向五年級奇獸飼育學班級介紹騎士墜鬼馬的場景。另一段被剪掉的戲裡，丹尼爾·雷德克里夫飾演的哈利在Glenfinnan的Glenfinnan Monument前打水漂。
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哈利在海格作陪的酒吧裡初次見到奎若教授時，伸手想跟他握手，奎若卻刻意不握。片尾顯示，哈利一碰到奎若，就因為對方的黑魔法與佛地魔的關聯而讓他身體崩解。後來在哈利波特：火盃的考驗（2005）中揭露，除非找到變通辦法，否則佛地魔碰不得哈利，這是因為他當年想殺害嬰兒哈利時所產生的魔法咒語。
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這是唯一一部石內卜直呼哈利名字的電影。先前的幾部片裡，他都叫他「波特先生」或「波特」。
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小說中「測盜器」的概念，以及天狼星·布萊克趁榮恩在霍格華茲睡覺時企圖攻擊他的支線，都曾拍成片段，但最終仍從完成版中刪去（部分畫面可在某些DVD版本中作為額外場景看到）。測盜器會在附近有人不老實時提醒主人。原著裡它經常作響，哈利因此以為它壞了，其實它感應到的正是斑斑／彼得·佩迪魯。另一場戲則如原著所述，布萊克闖進葛來分多宿舍，把榮恩的床誤認成哈利的；據了解，布萊克能進房是因為他從奈威·隆巴頓遺失的名單上得知了通關密語。後一場戲中哈利談到自己錯失抓住布萊克的機會，這一小段曾在多數宣傳預告片中佔有顯眼位置。
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（約1小時30分處）約1小時30分時，哈利在森林裡來到佛地魔面前，佛地魔稱他為「活下來的男孩」。海格在《Harry Potter and the Sorcerer's/Philosopher's Stone》第1章裡就是這樣叫他的。佛地魔和海格是僅有這樣稱呼他的人。
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（約1小時7分處）約1小時7分時，丹尼爾·雷德克里夫飾演的哈利、魯伯特·葛林特飾演的榮恩和艾瑪·華森飾演的妙麗在討論哈利與張秋（梁佩詩飾）接吻的事，3人演到這場戲尾聲時忍不住笑場。那全是他們3人真實的笑聲。導演大衛·葉慈覺得這樣對這場戲很好，就讓攝影機繼續拍下去。
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雖然電影裡從未明說，最後一集小說暗示哈利與佛地魔透過死神聖物傳說中的3兄弟而有親戚關係。哈利是伊諾特·皮福雷的遠親，他因此得到隱形斗篷；佛地魔則與卡德馬·皮福雷有親屬關係，因而在不知情下繼承了重生石（他把它鑲進戒指，並用戒指做成分靈體）。
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與小說不同，哈利的靈魂來到生死交界時是衣著整齊，而非赤裸。這很可能是為了顧及較年輕觀眾而做的審查。
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路平教授教哈利護法咒以抵禦催狂魔的場景，是在哈利波特：消失的密室（2002）中作為鄧不利多辦公室的片場拍攝的。阿方索·卡隆很喜歡這個片場，想在這部片裡使用。由於劇本完全沒提到鄧不利多的辦公室，這個片場於是被重新布置成另一個完全不同的房間（劇本中稱為天文學教室）。到了哈利波特：火盃的考驗（2005）及之後的電影，它又恢復成鄧不利多的辦公室。
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天狼星·布萊克的背景故事與上一部片裡的海格如出一轍。海格數十年前曾被佛地魔誣陷，因而遭到退學。當他再度被指控時，被送進阿茲卡班。全靠哈利、榮恩和妙麗的努力，他才得以洗清罪名。天狼星則是被彼得·佩迪魯誣陷洩漏波特夫婦的藏身處給佛地魔。哈利、榮恩和妙麗得知了真相，但天狼星的情況是，他至死都未能洗刷罪名。在哈利波特：神秘的魔法石（2001）中，海格騎著一輛飛天機車登場，原著裡他說那是向天狼星借來的。而在這部片中，天狼星是騎著海格的鷹馬逃走的。
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雖然意若思鏡並未在小說中出現，卻在電影裡亮相了。哈利被佛地魔附身時可以看到它，而當哈利靠近鏡子，他的臉會顯現出扭曲、帶有部分黑魔王特徵的模樣。導演大衛·葉慈與美術指導史都華·克雷格決定把它放在那裡，作為本系列眾多向先前電影物件與鏡頭致敬的例子之一。
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當跩哥嘲諷哈利時，金妮·衛斯理挺身為哈利說話，跩哥便開玩笑說哈利交了女朋友。這為《哈利波特：混血王子的背叛》埋下伏筆，因為哈利和金妮後來確實成了一對。
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（約48分鐘處）胖女士失蹤期間，可以看到卡多甘爵士（保羅·懷特豪斯飾）在榮恩、哈利和妙麗身後穿梭於好幾幅畫之間跳躍。在書中，胖女士不在時他成為葛來分多交誼廳門口的臨時守衛（學生們為此相當頭痛，因為他老是向他們下戰帖），電影裡他也有類似的角色，直到他糊塗地讓天狼星·布萊克因為得知通關密語而進入葛來分多交誼廳。他在本片的戲份幾乎被刪光，只留下這幾個鏡頭。
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在本片結尾，哈利有2個兒子和1個女兒，其中1個他喚作「阿不思·賽佛勒斯·波特」。從未被點名的大兒子是詹姆·天狼星·波特（以哈利的父親和教父命名）。女孩的名字則是莉莉·露娜·波特（以哈利的母親和好友露娜·羅古德命名）。
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希朗·漢德（飾演阿波佛·鄧不利多）曾未掛名演出哈利波特（丹尼爾·雷德克里夫飾）隨身攜帶的鏡子碎片中數度浮現的巫師臉孔。他在《哈利波特：死神的聖物2》中有更吃重的戲份。
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石內卜教授與伊果·卡卡洛夫討論黑魔標記的那場戲，原本應該更長，而且出現在片中更早的位置：哈利想暫時逃離榮恩和妙麗在耶誕舞會上的爭吵，走到外頭，無意間聽見石內卜和卡卡洛夫的談話（正如書中情節）。當他回到城堡內，榮恩和妙麗仍在拌嘴，妙麗便把兩個男生打發上床睡覺。後來決定重拍這場戲，並把它與第2項任務之後石內卜盤問哈利的情節合併。這場被刪掉的戲說明了為何舞會上妙麗氣沖沖地丟下哈利和榮恩離去，下一場戲哈利卻突然撞見榮恩和妙麗，而妙麗還問他去了哪裡。在ABC Family播出的加長版中，石內卜教授質問哈利是否偷了他魔藥櫃裡的東西，石內卜說完「蛇蛻皮？lacewing flies？」後，當著哈利的面把門關上。這句「你和你的小朋友們在熬製變身水，相信我，我一定會查個水落石出」在該版本中被刪去，但收錄在DVD裡。它極可能取代了一場被刪的戲，戲中妙麗聽聞此事，立刻認出這些材料是變身水的成分。
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電影從未明確交代耶誕節時是誰把隱形斗篷送給哈利，儘管鄧不利多教授意味深長地看了他一眼。書中則說明這件斗篷原屬哈利的父親，他把它交給鄧不利多保管。鄧不利多後來把它轉交哈利，理由是哈利的父親希望由他擁有。書和電影都多次暗示，鄧不利多把斗篷給哈利，是為了讓他能靠它暗中調查、偷聽談話來解開謎團（這也解釋了鄧不利多為何對哈利經常在這麼做時違反校規如此寬容）。
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導演艾方索·柯朗有個想法，讓哈利、榮恩和妙麗比霍格華茲制服更常穿便服，以展現角色更多的個性。他也允許其他霍格華茲學生隨意穿著制服，好讓這所巫師學校更有真實感，因此有些學生把制服穿得一絲不苟，有些則襯衫和領帶都鬆垮垮地露在外頭。
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連接霍格華茲與周圍地景的那座搖搖晃晃的木橋，原本打算完全在棚內以綠幕為背景搭建，好讓電影工作者在後製時以數位方式加上背景。雖然有幾場戲在棚內拍攝，艾方索·柯朗仍決定把哈利與路平教授談論自己父母的那場戲拉到蘇格蘭實地拍攝。劇組在高地搭建了一段橋，儘管它比看起來堅固得多，但強勁無比的風仍是一大考驗。
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在本片中，佛地魔能感應到分靈體被摧毀，每當1個分靈體被毀，他就顯得痛苦難耐。哈利和娜吉妮因為體內各有一部分佛地魔的靈魂，也同樣感受到分靈體被毀。佛地魔死前，從他的表情可推知他曉得自己最後1個分靈體娜吉妮已被殺，因而使他變回凡人。
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雖然本片和小說都沒有揭露是哪個食死人殺了嘿美，許多粉絲推測凶手是石內卜。這套理論認為，石內卜之所以下手，是因為他意識到嘿美會暴露哪個才是真正的哈利，於是殺了她來保護他。
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整個分類帽與哈利的段落，可以算作最後1部電影的伏筆。分類帽似乎非常想把哈利分到史萊哲林，認為這會帶給他「偉大」。哈利體內其實有佛地魔靈魂的碎片，因此分類帽在分類時把他與佛地魔相提並論。
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在《哈利波特：神秘的魔法石》（2001）約1小時55分鐘處，哈利的巧克力蛙從霍格華茲特快車的窗戶飛了出去。牠的下落不明，但在本片尾聲，可以看到1隻巧克力蛙爬上衛斯理家和波特家孩子們車廂的窗戶，暗示牠很可能就是同一隻。
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哈利（丹尼爾·雷德克里夫）在霍格華茲度過第一個聖誕節時，弗雷（詹姆斯·菲爾普斯）和喬治（奧利弗·菲爾普斯）對雪球施了魔法，讓它們飛過去砸中奎若教授（伊恩·哈特）頭巾的後方。他們這麼做，等於在不知不覺中打中了佛地魔的臉。
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路平私下替哈利補習如何擊敗催狂魔，並用幻形怪當作替代品。然而，哈利第1次和第2次面對幻形怪都沒能擊敗它，幻形怪／催狂魔還讓哈利聽見母親的尖叫聲。這或許意味著幻形怪能獲得其所變身之物的部分能力；它同時也承襲了弱點，因為它輕易就被哈利的護法擊敗。
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在小說中，妙麗用了速順髮魔藥這種護髮藥水，把頭髮拉直以出席耶誕舞會。J.K.羅琳後來在Pottermore上揭露波特家族背景時提到，這款藥水是哈利的祖父福萊蒙·波特發明的。
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雖然書中清楚暗示哈利是伊諾特（伊格內修斯）·皮福雷的後裔，也就是《吟遊詩人皮陀故事集》裡三兄弟故事中排行第3、最年幼的那位，但書和電影推出時，對於哈利如何取得隱形斗篷並沒有進一步說明。2015年9月，J.K.羅琳透露了箇中細節：哈利的其中一位祖先是個古怪的巫師，名叫斯廷奇庫姆的林弗雷德，綽號「波特佬」，波特這個姓氏便由此而來（後來被縮短），他以用植物和藥草製作各種藥劑聞名，包括第2集電影裡出現的增骨藥。林弗雷德的長子哈德溫娶了高錐客洞的美麗女巫伊奧蘭瑟（尤蘭達）·皮福雷，她是伊諾特的孫女。由於她那一代沒有男性繼承人，身為長女的她便繼承了斗篷。她嫁給哈德溫時，唯一的願望和條件是斗篷與傳家寶如何流入她家族之手必須保密，哈德溫也同意並尊重這點。從那時起直到現在，斗篷都傳給每一代的新生代長子，最後傳給哈利的父親詹姆，再傳到哈利手上。
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電影裡有一幕是食死人由貝拉·雷斯壯和焚銳·灰背帶領，攻擊哈利、衛斯理一家、路平和東施暫住的洞穴屋。這一幕原著中並沒有，是專為電影而加，用來代表原著中散見各處、關於食死人攻擊巫師社群的種種新聞報導。電影界認為，讓哈利親身經歷一次這類攻擊，會比讓他聽聞或讀到其他學生或其親屬不斷遭遇的攻擊，更能掌握電影的節奏。
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哈利在魁地奇比賽中失去對光輪2000的控制時，妙麗把望遠鏡對準教師們坐的觀眾塔。若仔細看，在望遠鏡拉近到石內卜喃喃念著反咒之前，可以看見奎若雙眼緊盯著哈利的掃帚（想必是在施展無聲咒）。
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（約30分鐘處）大約在第30分鐘，這是第1部沒有在銀幕上呈現任何黑魔法防禦術課程內容的哈利波特電影，無論是直接呈現（《哈利波特：消失的密室》（2002）到《哈利波特：鳳凰會的密令》（2007）），還是間接呈現（《哈利波特：神秘的魔法石》（2001））。全片唯一提到這個科目，是鄧不利多（麥可·坎邦爵士）宣布石內卜（艾倫·瑞克曼）出任這個懸缺教職的時候。原著則描寫了石內卜的一堂課，他照例挑釁哈利，引他回嘴，好藉機罰他留校察看。
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（約46分鐘處）路平說自己和哈利的母親非常親近。這似乎與原著中莉莉·伊凡是他死對頭賽佛勒斯·石內卜的摯友一說有所牴觸。不過，J.K.羅琳透露，路平從霍格華茲畢業後仍很難找到有薪工作，因為沒有人願意雇用狼人。因此，詹姆和莉莉在經濟上資助他。
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（約1小時55分鐘處）大約在1小時55分鐘，哈利在神秘部門的尖叫聲被消音，因為那實在太痛苦了。大衛·葉慈把尖叫聲消音，是向《教父Ⅲ》（1990）中麥可·柯里昂的吶喊致敬。
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榮恩在占卜課上替哈利做的預言說他會受苦，但會為此感到高興，到了電影結尾竟真的應驗了。他因為「得知」天狼星殺了他父母而痛苦，結果發現這並非事實，而且天狼星其實能給哈利一個充滿愛的家。這也可能是指哈利因為知道自己有個充滿愛的家可回，卻永遠回不去而痛苦（受苦的部分），而開心的部分則是得知天狼星重獲自由，也發現自己還有家人。
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片中加了3個原著沒有的新場景：崩塌的千禧橋（出現在本片開頭，也出現在第3支預告片裡）；哈利（丹尼爾·雷德克里夫）在車站和女服務生（艾拉瑞卡·強森）調情，之後才與鄧不利多（麥可·坎邦爵士）會合；以及食死人在洞穴屋的攻擊（見於第2支預告片）。原著開頭其實由康尼留斯·夫子提過麻瓜橋梁遇襲，但只是事後追述。
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本片開頭，哈利確實施了未成年魔法，卻沒有被魔法部透過追蹤咒查到。
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在與梅森夫婦共進晚餐的場景中，威農姨丈查看哈利房間之後，出現了一段巧妙的伏筆。威農姨丈離開臥室後，躲藏的家庭小精靈從哈利的衣櫃出來，隨手把一隻不小心黏在他肩上的哈利的襪子丟到一旁。這預示了哈利日後終將用一隻襪子讓多比脫離奴役。
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（約25分鐘處）在「黑魔法」課堂上被瘋眼穆迪折磨的那隻生物，書中和原劇本裡都是蜘蛛；電影中的生物則幾乎與真實動物無異，即無尾鞭蠍（又稱無尾鞭蛛）。已知約有70種的無尾鞭蠍自成一目「Amblypygi」，歸於「蛛形綱」之下，既不是蠍子也不是蜘蛛。穆迪雖說這隻生物致命，但真實的Amblypygi其實相當無害（體型倒是差不多大）。片中可聽見牠受折磨時發出尖銳叫聲；書裡牠並沒有出聲，但哈利想像牠若能叫，大概就會這樣叫。
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當哈利問起他與佛地魔決鬥時所見的亡者幽靈，鄧不利多只提到「Priori Incantatem」這個詞，並未多加解釋。有些台詞寫進劇本卻很可能被剪掉，內容是（如書中所述）鄧不利多說明哈利與佛地魔的魔杖杖芯都取自鄧不利多的鳳凰佛客使的羽毛。這種「兄弟魔杖」一旦相鎖，便可能自發產生Priori Incantatem（「前咒再現」）效應：若其中一方能壓制另一方，較弱的那根魔杖就會被迫重現它最近施過的咒語，包括遭索命咒殺害者的幽靈回響。這些回響只維持片刻，因此鄧不利多在片中說：「沒有任何咒語能讓死者復活，哈利。」這場戲原本設定在鄧不利多的辦公室，就在小巴堤·柯羅奇身分被揭穿之後；而鄧不利多關於在「正確」與「容易」之間抉擇的獨白，原本安排在他對學生的最後演說中，但兩者都改寫成發生在哈利的宿舍裡。
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本片的儲思盆與《哈利波特：火盃的考驗》（2005）中的版本不同。這裡的儲思盆不知怎地能漂浮在半空中，想來是符咒所致；這回也不見哈利身在盆中，但也可說哈利是以第一人稱視角觀看那些記憶。與原著及本片設定不同的是，哈利在沒有鄧不利多陪同下看了前兩段記憶，不過片中暗示兩人曾一起看過史拉轟的真實記憶。
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本片有一首新樂曲〈Lily's Theme〉共出現3次。最後一次是哈利與母親莉莉·波特說話的時候；另外兩次分別在開場場景，石內卜眺望破敗的中庭時，以及他死亡的場景，暗示他對莉莉那份無回報的愛。
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史拉轟在史拉俱樂部的照片中展示莉莉·波特時，她腹部微隆，穿著寬鬆的洋裝，暗示拍照當時莉莉已懷了哈利。
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電影製作團隊原本想請Grace Jones為人面獅身獸配音。書中哈利在迷宮裡遇到牠，牠給哈利3個選擇：他可以選擇保持沉默，牠便讓他毫髮無傷地離去；答對的話牠會讓開；答錯的話牠就會攻擊。然而，由於其餘特效已超支，這場戲最終被剪掉，計畫未能實現。
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約在1小時7分鐘處，霍格華茲的一場戰鬥戲裡有個向前3集怪物致敬的安排。哈利、榮恩和妙麗在校園裡奔跑時，先後遇上第1集的巨怪、第2集的蜘蛛，最後是第3集的催狂魔。
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當榮恩問哈利，他在金庫裡要如何辨認赫夫帕夫的金杯是分靈體時，哈利回答他認得出來。這呼應了原本為《哈利波特：混血王子的背叛》（2009）所寫的4段瑞斗回憶之一，正是那段回憶帶出這個關鍵道具。然而導演大衛·葉慈認為這會讓佛地魔的身世過於複雜，選擇不把它放進片中。對不熟悉原著的觀眾來說，那段回憶描述年輕的湯姆·瑞斗拜訪赫加·赫夫帕夫的後裔赫普茲巴·史密斯，以取得那只珍貴的金杯，並為了奪杯而將她毒死。
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（約1小時50分鐘處）哈利進入迷宮時，瘋眼穆迪示意他該向左轉。一般相信，在迷宮裡只要一直向左轉，就能找到出口。這對文藝復興之後英國貴族庭園裡的大多數「樹籬迷宮」確實管用，例如漢普頓宮那座著名的迷宮；但對現代益智書裡的解謎迷宮就不成立了。
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（約1小時45分鐘處）哈利在鄧不利多辦公室與他交談時，看完小巴堤·柯羅奇的記憶回顧後，當鄧不利多望向玻璃櫃，可以看到死神的聖物符號。
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隨著劇情推進，鄧不利多的身體越來越虛弱，聲音也越來越沙啞。這是因為戒指上的詛咒正一點一滴侵蝕著他；正如《哈利波特：死神的聖物Ⅱ》所揭示，石內卜曾警告過他，這個詛咒只能暫時壓制。這也說明了鄧不利多為何要石內卜殺他：既是為了讓他免於痛苦，也是為了保護跩哥馬份，同時鞏固自己在食死人中的地位。鄧不利多臨死前呼喚賽佛勒斯，並非在求他手下留情，而是要他動手殺了自己。
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「我現在可以碰你了」是雷夫·范恩斯在整個哈利波特電影系列中最喜歡的一句台詞，出自佛地魔碰觸哈利額頭的時候。
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在第三幕，哈利與妙麗用時光器回到過去時，配樂中恰如其分地不時響起碼錶的滴答聲，成為樂曲中顯著的一部分。
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（約14分鐘處）約在14分鐘時，哈利對銀行裡的小妖精施展蠻橫咒，這是他首次使用3大不赦咒之一。他先前曾在《哈利波特：鳳凰會的密令》（2007）中對貝拉·雷斯壯用過酷刑咒，也在《哈利波特：死神的聖物》（2010）的一場刪減片段中，對史萊哲林小金匣試用過索命咒。
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原著小說中另有2場魁地奇比賽，第1場是葛來分多對上雷文克勞。催狂魔同樣在比賽中現身，但哈利施展完整的護法咒成功將牠們驅離。不過事後他才知道，那些並非真正的催狂魔，而是4名史萊哲林學生假扮的，想藉此擾亂哈利的表現。第2場則是決賽，由葛來分多對上史萊哲林，最後由前者勝出，葛來分多因此同時拿下魁地奇盃與學院盃。
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在小說裡，海格在聖誕節送給哈利一支笛子，後來哈利便是用這支笛子讓毛毛陷入沉睡。
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把哈利困在地牢裡、與奎若和佛地魔同處一室的火焰並未出現在小說中，但其靈感來自小說裡哈利與妙麗在贏得西洋棋關卡後，面對7個藥水瓶與彩色火焰的情節（電影中並未收錄這段）。地牢四周烈焰的實體特效，是靠著鋪設在地牢布景周圍地板上的管線完成，並在伊恩·哈特彈指之後點燃。
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與小說不同，哈利（丹尼爾·雷德克里夫）和金妮（邦妮·萊特）在聖誕假期間成為情侶。電影從未交代金妮與丁（阿爾弗雷德·伊諾克）分手的原因，但強烈暗示兩人經常爭吵，妙麗（艾瑪·華森）在史拉轟俱樂部那場戲中便有所暗示。
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本片中，海格帶給哈利的生日蛋糕上頭寫著「Happee Birthdae Harry」。小說裡海格確實送了哈利一個生日蛋糕，但J·K·羅琳明確寫道海格完全能正確拼出蛋糕上的祝賀詞，形容那是「一個又大又黏的巧克力蛋糕，上頭用綠色糖霜寫著『Happy Birthday Harry』」。
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第1項任務的巨龍橋段用了超過140個視覺特效鏡頭。其中部分短暫畫面完全以電腦動畫製作，不只巨龍，連整個環境甚至哈利本人都是。
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在整個電影系列中，觀眾經常納悶嬰兒時期的哈利怎麼可能擊敗強大的佛地魔，而這個問題最完整的解答，可以說是由佛地魔本人在本片中親口給出。佛地魔在復活後說道：「要我透露我究竟是怎麼失去力量的嗎？是愛。你看，當親愛的莉莉·波特為她唯一的兒子犧牲性命，便給了他終極的保護。我碰不了他。那是古老的魔法，是我早該預見的。」第5集小說進一步說明，莉莉出於愛的犧牲，讓她的血液在哈利周身形成魔法保護，使佛地魔的索命咒反彈並殺死他自己。由於這道魔法保護存續於哈利的血液中（與他母親的血相似），佛地魔對哈利的觸碰始終極為脆弱；哈利的血對他的復活之所以如此關鍵，正是因為這終於能讓佛地魔不再受哈利觸碰所傷。這道血液魔法保護強大到連莉莉的姊姊、同樣與她血脈相連的佩妮阿姨也適用。佩妮在附近時，哈利便受到魔法庇護而免於傷害，這也是哈利必須一再回到德思禮家的原因。
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哈利在《哈利波特：火盃的考驗》（2005）中穿的那件背後印著「POTTER」的三巫鬥法大賽斗篷，可以在部分船屋場景的背景中看到。
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在佛地魔8片靈魂碎片中，鄧不利多的戒指、妙麗的杯子、榮恩的墜盒與奈威的蛇各摧毀了1片。佛地魔無意間毀掉了哈利體內的那片，而哈利則摧毀了2片——日記與王冕（不過僅限電影；小說中王冕是遭克拉點燃的惡火燒毀）。最後1片藏於佛地魔自身體內，於霍格華茲大戰期間，佛地魔施咒反彈到自己身上時被摧毀。
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小說與電影對蛇妖體型的描述有所出入，後者暗示牠的體型要大得多。小說第16章末尾，哈利、榮恩與洛哈發現蛇皮時，敘述寫道「留下這層皮的生物起碼有20英尺長」。電影對應的場景中，榮恩則說「不管留下這個的是什麼，一定有60英尺長，甚至更長」。這很可能是為了讓哈利與蛇妖的搏鬥顯得更刺激、更危險，畢竟20英尺長的蛇，體型還比較接近哈利在第1集電影裡從動物園放出來的那條蟒蛇。
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丹尼爾·雷德克里夫與艾瑪·華森表示，導演要求他們在共舞結束時演出哈利與妙麗之間一瞬間的曖昧張力，兩人差點吻下去，但妙麗想起了榮恩，這一刻便就此打住。
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阿不思·鄧不利多（麥可·坎邦）與系列其他電影不同，在某些場景中會大吼或提高音量，例如哈利被火盃選中時、他問哈利是否把自己的名字投入火盃時，以及與冒充瘋眼穆敵的巴堤·柯羅奇二世對質時。許多哈利波特粉絲對此嚴加批評，因為劇本並未對此做出明確指示，而小說中的鄧不利多被形容為非常沉穩、從容，正如李察·哈里斯在前2集電影中的詮釋；即使提高音量，鄧不利多也總是以最克制的方式為之。不過坎邦表示，他是以自己的方式詮釋這個角色，並未參考原著，因為他從沒讀過小說，認為「讀了也沒意義」，畢竟「我演的每個角色都只是我自己個性的變體」。
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許多粉絲批評哈利在火車站看見佛地魔穿著麻瓜西裝的那場戲，認為佛地魔不可能做出這種事，有違角色性格。導演大衛·葉慈與製片大衛·海曼都為這場戲辯護，但兩人看法各有不同。葉慈解釋，這是佛地魔嘲弄哈利的方式，意在表明佛地魔能光明正大地現身於一群麻瓜之中，而他們根本不會察覺他有多危險。海曼則認為，那只是哈利想像出來的幻象，象徵佛地魔正掌控哈利的心智。
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雖然只是演戲，但魯伯特·葛林特坦言，演出榮恩刻意坐在哈利與妹妹金妮之間、把剛獨處的兩人拆散的那場戲時，他心裡其實有點罪惡感。
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當哈利（丹尼爾·雷德克里夫）、榮恩（魯伯特·葛林特）和妙麗（艾瑪·華森）喝下變身水變成魔法部員工時，妙麗化身為名叫「Mafalda Hopkirk」的女子。Mafalda Hopkirk正是《哈利波特：鳳凰會的密令》（2007）中，哈利因使用護法咒而被開除學籍後，寄信通知他的那位女巫；她也在《哈利波特：消失的密室》裡，因多比砸爛紫色布丁、哈利未成年施法而寄出警告信給他。
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哈利對那枚戒指有短暫的反應，為「Harry Potter and the Deathly Hallows」的情節埋下伏筆，因為這是編劇們首度在已知系列結局的情況下寫出的劇本。
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有別於原著，哈利從未開口問鄧不利多他那隻焦黑的手是怎麼受傷的，儘管鄧不利多提到這段故事很精彩，卻決定暫時不告訴他。
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戴眼鏡並不能讓人免於蛇妖目光的致命效果，因為眼鏡仍會讓視線直接而清晰地與蛇眼相接，這點和照鏡子或透過相機觀看不同。這正是愛哭鬼麥朵喪命的原因；而哈利之所以安然無恙，是因為鳳凰佛客把蛇妖弄瞎了。
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在《哈利波特：消失的密室》（2002）結尾，哈利要多比答應他，以後絕不再試圖救他的命。而拯救哈利的性命，正是多比在這部電影中喪命的原因。
